Gurdon Institute Xenopus laevis EST Database
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Application in use by Guest User - 18 Jan 2021 - database INFO-PUBLIC
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By Clone or Sequence Name
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Related Clusters
CS% VC Transcript Size Type Links % In % Out Identified Blast Description.
1 2.0 0Xl3.1-IMAGE:3402349-IMAGp.5.5 27 END 1 5 3 forkhead box I1 [Xenopus tropicalis]
2 2.0 0Xl3.1-xl267i20.3 4 END 1 5 25 (no blast hit)
3 1.5 0Xl3.1-XL211j19.3 3 END 2 10 66 (no blast hit)
CS% VC Transcript Size Type Percent From To Identified Blast Description.
4 0.0 0Xl3.1-IMAGE:6632624.5 7 PI 82 4 808 Unknown (protein for MGC:82909) [Xenopus laevis]
5 0.0 0Xl3.1-xl267i20.3 4 PI 95 1664 2055 (no blast hit)
This cluster: approximate FL confidence score = 98%
1012773978 Xl3.1-xl287n02.3 - 19 ESTs
.........0.........10........20........30........40........50........60........70........80........90........100.......110.......120.......130.......140.......150.......160.......170.......180.......190.......200.......210.......220.......230.......240.......250.......260.......270.......280.......290.......300.......310.......320.......330.......340.......350.......360.......370.......380.......390.......400.......410.......420.......430.......440.......450.......460.......470.......480.......490.......500.......510.......520.......530.......540.......550.......560.......570.......580.......590.......600.......610.......620.......630.......640.......650.......660.......670.......680.......690.......700.......710.......720.......730.......740.......750.......760.......770.......780.......790.......800.......810.......820.......830.......840.......850.......860.......870.......880.......890.......900.......910.......920.......930.......940.......950.......960.......970.......980.......990.......1000......1010......1020......1030......1040......1050......1060......1070......1080......1090......1100......1110......1120......1130......1140......1150......1160......1170......1180......1190......1200......1210......1220......1230......1240......1250......1260......1270......1280......1290......1300......1310......1320......1330......1340......1350......1360......1370......1380......1390......1400......1410......1420......1430......1440......1450......1460......1470......1480......1490......1500......1510......1520......1530......1540......1550......1560......1570......1580......1590......1600......1610......1620......1630......1640......1650......1660......1670......1680......1690......1700......1710......1720......1730......1740......1750......1760......1770......1780......1790......1800......1810......1820......1830......1840......1850......1860......1870......1880......1890......1900......1910......1920......1930......1940......1950......1960......1970......1980......1990......2000......2010......2020......2030......2040......2050......2060......2070......2080......2090......2100......2110......2120.
? ? ? ? ? ? ? ?
Xl3.1-xl287n02.3 GCCATTTAGCGCTGCTGCTGCCTGGGATCCCGAGAGCGGAGCCGCTCAGTCACATCGCTAGTATCCGGCAGAGTGTAAGCTCCGCTGTCACACGCACTCAAGGCGCAACAATAGTTTCACTGGGATTTCTCGCTACTTTCACGTTTCCTTCACTTTCTGCAAGAGTTGTTGAGATTAAGTATCGGGATTGTACTCTGTTTCCCTCACACTTCATTTAGTGGATACAAGGATCGCGCTGGATTGGGGGAGCCTGGAACCCTGACACATGTTTTCTGTGTCCCTTCCTATCGGGCTTGGAGAGCTCCTGCTGAAAGTTGCACGAAGCGTAGCCCAGGGTTAACCCCCTATTGCCCAGTAACGGGAGCGGACGTCACGCAGGATTTCAGATGTGTTCTCAGCCCACTGGTGTGAAAACTCTTCAGAGTACTGATGGAGACGAGAGTACAAAATGGCAACGTATCCCAGCCTTTGCTCCCGGCTCGGCGTGACAATGGACGATTACACAGTGACACTGACCCACGGGAGATTTTAACACAGCAAGTTCATGTTTTGTCCTTGGAACAAATAAGAGCCATAAGAAACAGTAATGAATATACAGAAGGGCCCACAGTGGCTCCCCGCCCTGTGATTAAATCTGCTCCACGACAGACTACCCAACAGAAAAATGAAAGAATACACGTGGTAAATGAGCAGCGACCTTTTGTCAGGACTCCACATGCACCAATGCATTCCTTGTTTCAGGCATCTTTGTCTCGATCAGTTGGTGCAGCCAGTTCATCTTCTCGGAGCAATACAAGGACAAGTAGCAGTTCTTCAGAGCAAAGGCTTCTTGTACCACCATTTACATCTTCAGGGGTGGTTGCAGACCGAATAATTCGAGTACAGCCTAAACCTGAACTGAAATCTGACGTTTTAAAGCCCTCTAGTAAAGAGGAATTGGACTTACATTCATTAATGTGTGAGGATTGTGGAAAATGTAAGTGCCAAGAATGCACTTATCCAAGGACTCTCCCATCTTGTTGGATTTGTGACAAGCAGTGCCTTTGCTCAGCCCAGGAAGTAGTTGACTATGGAACTTGTGCTTGCTGTGTGAAGTGCCTTTTCTATCACTGTTCAAATGATGATGAGGATAATTGTGCGGACAACCCATGTTCTTGCAGTCAGTCCCACTGCTGCACTCGATGGTCTGCCATTGGCGTCATGGCCTTGTTCTTGCCCTGTTTGTGGTGTTACCTTCCAGCCAAGGGTTGCCTTAAATTGTGCCAGGGCTGCTATGACCGCGTAAATAGACCTGGATGTCAATGCAAAAGATCAAACACAGTTTGCCTTAAAGTTCCACACCTTCAGCCCAGGAACTTAGAAAAACCAACATAGCACAGGTGAACGGATGTTTATAAAGAACATAATAACTTCATTTAAACACTCAAATGCAACCATCTTGTTACATTTTCGGAAAAAGTGTTGGGATAGAATTTCCTGTCTGCGGTGAAATACTTGTCCGTCAACGGATTTAGCCTTAATAGAGAACCTCTAATAAAGCTTACAGTAGGATTCAATGTTCTGTGACGATTATTGTGTAAGCAATTGCAGCACAGGCACTCCTATGTACCATTGTATTGTTTGTGAATAGTACTTGGAACATTTGTAAAATTTGCAAATGGCCTTTATTTTGCCAGAGATATTATGCTATATTTTTGTACATAAAACATATTTACAACTGTGAAAAAAAGTGCCATATTTTTATGGCACAGTCACAAAATTAACTAATGTACATTCAAAAGAATGTGAATCAATCAGTATGGTTACATTGTCCTTCGCCTTCTGGAACTTTAATATTATCGGACTTTTATTCTTTGGATCTTATCTATATTGTACAGTTACACTGTAAGATTCAGCCTTTATTTTCTAATGTTTCAATATTGTTTAGTGTAAAGTATATTTATTTGAAGTTTTATTATTTTATAAAGAGAAATATTTATTTTATGAAGCATCTTACAAATGTCTCCCCTTTTTATGATGTAAGATTCTGCAAATTGGGGCTGACTGAGACATATGTTCACTATAAAATAGAAATAT
Xl3.1-CHK-1012690271 TAGCGCTGCTGCTGCCTGGGATCCCGAGAGCGGAGCCGCTCAGTCACATCGCTAGTATCCGGCAGAGTGTAAGCTCCGCTGTCACACGCACTCAAGxxGxxxCAATAGxxxCxCTGGGATTTCTCGCTACTTTCACGTTTCCTTCACTTTCTGCAAxAxxxGTTGAGAxxxxGTATCGGGATTGTACTCTGTTTCCCTCACACTTCATTTAGTGGATACAAGGATCGCGCTGGATTGGGGGAGCCTGGAACCCTGACACATGTTTTCTGTGTCCCTTCCTATCGGGCTTGGAGAGCTCCTGCTGAAAGTTGCACGAAGCGTAGCCCAGGGTTAACCCCCTATTGCCCAGTAACGGGAGCGGACGTCACGCAGGATTTCAGATGTGTTCTCAGCCCACTGGTGTGAAAACTCTTCAGAGTACTGATGGAGACGAGAGTACAAAATGGCAACGTATCCCAGCCTTTGCTCCCGGCTCGGCGTGACAATGGACGATTACACAGTGACACTGACCCACGGGAGATTTTAACACAGCAAGTTCATGTTTTGTCCTTGGAACAAATAAGAGCCATAAGAAACAGTAATGAATATACAGAAGGGCCCACAGTGGCTCCCCGCCCTGTGATTAAATCTGCTCCACGACAGACTACCCAACAGAAAAATGAAAGAATACACGTGGTAAATGAGCAGCGACCTTTTGTCAGGACTCCACATGCACCAATGCATTCCTTGTTTCAGGCATCTTTGTCTCGATCAGTTGGTGCAGCCAGTTCATCTTCTCGGAGCAATACAAGGACAAGTAGCAGTTCTTCAGAGCAAAGGCTTCTTGTACCACCATTTACATCTTCAGGGGTGGTTGCAGACCGAATAATTCGAGTACAGCCTAAACCTGAACTGAAATCTGACGTTTTAAAGCCCTCTAGTAAAGAGGAATTGGACTTACATTCATTAATGTGTGAGGATTGTGGAAAATGTAAGTGCCAAGAATGCACTTATCCAAGGACTCTCCCATCTTGTTGGATTTGTGACAAGCAGTGCCTTTGCTCAGCCCAGGAAGTAGTTGACTATGGAACTTGTGCTTGCTGTGTGAAGTGCCTTTTCTATCACTGTTCAAATGATGATGAGGATAATTGTGCGGACAACCCATGTTCTTGCAGTCAGTCCCACTGCTGCACTCGATGGTCTGCCATTGGCGTCATGGCCTTGTTCTTGCCCTGTTTGTGGTGTTACCTTCCAGCCAAGGGTTGCCTTAAATTGTGCCAGGGCTGCTATGACCGCGTAAATAGACCTGGATGTCAATGCAAAAGATCAAACACAGTTTGCCTTAAAGTTCCACACCTTCAGCCCAGGAACTTAGAAAAACCAACATAGCACAGGTGAACGGATGTTTATAAAGAACATAATAACTTCATTTAAACACTCAAATGCAACCATCTTGTTACATTTTCGGAAAAAGTGTTGGGATAGAATTTCCTGTCTGCGGTGAAATACTTGTCCGTCAACGGATTTAGCCTTAATAGAGAACCTCTAATAAAGCTTACAGTAGGATTCAATGTTCTGTGACGATTATTGTGTAAGCAATTGCAGCACAGGCACTCCTATGTACCATTGTATTGTTTGTGAATAGTACTTGGAACATTTGTAAAATTTGCAAATGGCCTTTATTTTGCCAGAGATATTATGCTATATTTTTGTACATAAAACATATTTACAACTGTGAAAAAAAGTGCCATATTTTTATGGCACAGTCACAAAATTAACTAATGTACATTCAAAAGAATGTGAATCAATCAGTATGGTTACATTGTCCTTCGCCTTCTGGAACTTTAATATTATCGGACTTTTATTCTTTGGATCTTATCTATATTGTACAGTTACACTGTAAGATTCAGCCTTTATTTTCTAATGTTTCAATATTGTTTAGTGTAAAGTATATTTATTTGAAGTTTTATTATTTTATAAAGAGAAATATTTATTTTATGAAGCATCTTACAAATGTCTCCCCTTTTTATGATGTAAGATTCTGCAAATTGGGGCTGACTGAGACATATGTTCACTATAAAATAGAAATATATTAAC
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5 1 2 bld Em10 5g IMAGE:8319302.5p CGAGAGCGGAGCCGCTCAGTCACATCGCTAGTATCCGGCAGAGTGTAAGCTCCGCTGTCACACGCACTCAAGGCGCAATAGTTTCACCTCTGGGATTTCTCGCTACTTTCACGTTTCCTTCACTTTCTGCAAGAGTTGAGATTAAGTTGTATCGGGATTGTACTCTGTTTCCCTCACACTTCATTTAGTGGATACAAGGATCGCGCTGGATTGGGGGAGCCTGGAACCCTGACACATGTTTTCTGTGTCCCATCCTATCGGGCTTGGAGAGCTCCTGCTGAAAGTTGCACGAAGCGTAGCCCAGGGTTAACCCCCTATTGCCCAGTAACGGGAGCGGAGGTCACGGATTTCAGATGTGTTCTCAGCCCACTGGGGTGAAAACTCTTCAGAGTACTGATGGAGACGAGAGTACAAAATGGCAACGTATCCCAGCCTTTGCTCCCGGCTCGGCGTGACAATGGACGATTACACAGTGACACTGACCCACGGGAGATTTTAACACAGCAAGTTCATGTTTTGTCCTTGGAACAAATAAGAGCCATAAGAAACAGTAATGAATATACAGAAGGGCCCACAGTGGCTCCCCGCCCTGTGATTAAATCTGCTCCACGACAGACTACCCAACAGAAAAATGAAAGAATACACGTGGTAAATGAGCAGCGACCTTTTGTCAGGACTCCACATGCACCAATGCATTCCTTGTTTCAAGCATCTTTG
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5 1 2 bld Oo1 5g IMAGE:6638496-IMAGp.IMAGp CTCAGCCCACTGGTGTGAAAACTCTTCAGAGTACTGATGGAGACGAGAGTACAAAATGGCAACGTATCCCAGCCTTTGCTCCCGGCTCGGCGTGACAATGGACGATTACACAGTGACACTGACCCACGGGAGATTTTAACACAGCAAGTTCATGTTTTGTCCTTGGAACAAATAAGAGCCATAAGAAACAGTAATGAATATACAGAAGGGCCCACAGTGGCTCCCCGCCCTGTGATTAAATCTGCTCCACGACAGACTACCCAACAGAAAAATGAAAGAATACACGTGGTAAATGAGCAGCGACCTTTTGTCAGGACTCCACATGCACCAATGCATTCCTTGTTTCAGGCATCTTTGTCTCGATCAGTTGGTGCAGCCAGTTCATCTTCTCGGAGCAATACAAGGACAAGTAGCAGTTCTTCAGAGCAAAGGCTTCTTGTACCACCATTTACATCTTCAGGGGTGGTTGCAGACCGAATAATTCGAGTACAGCCTAAACCTGAACTGAAATCTGACGTTTTAAAGCCCTCTAGTAAAGAGGAATTGGACTTACATTCATTAATGTGTGAGGATTGTGGAAAATGTAAGTGCCAAGAATGCACTTATCCAAGGACTCTCCCATCTTGTTGGATTTGTGACAAGCAGTGCCTTTGCTCAGCCCAGGAAGT
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