Gurdon Institute Xenopus laevis EST Database |
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+ | Application in use by Guest User - 11 Apr 2021 - database INFO-PUBLIC | = |
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Xl3.1-IMAGE:4743353.5 CTTGCACAGCACAAACAATTGTTGACAACTCTTCAGCTTCAGCTGATCTTGTAGTCAGAGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGTGGTATCAGAGTAGAAGAACTAAGAGATACTTCTGTAAAATTAACATGGAGTAGTGGAACCGACAATCACCAGCCAATTTCTAAGTATAACATCCAGGCAAGAAATATTTTGTCTGACGACTGGAAAGATGTAAAGACAGAAAATCCAAACATTGAAGGATATATGGAGATGGCAAGAGTTATAGATCTGATTCCTTGGATGGACTATGAATTCCGGGTTATAGCAACAAACACATTAGGAGTTGGAGAACCAAGCTTGCCATCCCCAAAAATAAGAACAGAGGGAGCTGCACCTATTGTAGCTCCTGCAGAAGTTGGCGGTGGTGGTGGAAGCAATCGTGAGTTAACAGTAACATGGCAGCCTTTGTCACGTGAATATCATTATGGTGATGGCTTTGGCTATGGTGTCGCCTTCAAGCCCTTCAATGTCAGGGAATGGAGAAAAGTTATTGTTTCCAACCCTGAAAGTGGTCACTATGTGCACAAGGATGACACCATAACTCCAGCAACACAGTTTCAAATAAAAGTAAAGGCCTTTAATAAAGTTGGAGAAGGTCCATACAGCAGCACTGTTGTAGTATACTCAGCAGAGGATGTGCCTACAGAAGCCCCAACGGCAGTAGTATACAATATATTGTCATCTACTGAAGTATCTGTTGCCTGGCATCCAGTTTATGAGAAATCTATTG Xl3.1-CHK-1012717099 CAGCACAAACAATTGTTGACAACTCTTCAGCTTCAGCTGATCTTGTAGTCAGAGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGTGGTATCAGAGTAGAAGAACTAAGAGATACTTCTGTAAAATTAACATGGAGTAGTGGAACCGACAATCACCAGCCAATTTCTAAGTATAACATCCAGGCAAGAAATATTTTGTCTGACGACTGGAAAGATGTAAAGACAGAAAATCCAAACATTGAAGGATATATGGAGATGGCAAGAGTTATAGATCTGATTCCTTGGATGGACTATGAATTCCGGGTTATAGCAACAAACACATTAGGAGTTGGAGAACCAAGCTTGCCATCCCCAAAAATAAGAACAGAGGGAGCTGCACCTATTGTAGCTCCTGCAGAAGTTGGCGGTGGTGGTGGAAGCAATCGTGAGTTAACAGTAACATGGCAGCCTTTGTCACGTGAATATCATTATGGTGATGGCTTTGGCTATGGTGTCGCCTTCAAGCCCTTCAATGTCAGGGAATGGAGAAAAGTTATTGTTTCCAACCCTGAAAGTGGTCACTATGTGCACAAGGATGACACCATAACTCCAGCAACACAGTTTCAAATAAAAGTAAAGGCCTTTAATAAAGTTGGAGAAGGTCCATACAGCAGCACTGTTGTAGTATACTCAGCAGAGGATGTGCCTACAGAAGCCCCAACGGCAGTAGTATACAATATATTGTCATCTACTGAAGTATCTGTTGCCTGGCATCCAGTTTATGAGAAATCTATTGAAGGTT consensus depths 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...PROTEIN --- Ce ---- 8e-024 NP_501339.2 neuRonal IGCAM family member (rig-4) [Caenorhabditis elegans] 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...PROTEIN --- Xt ---- 1e-028 NP_001096185.1 L1 cell adhesion molecule [Xenopus tropicalis] 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...PREDICTED - Sp ---- 1e-037 XP_001181157.1 PREDICTED: similar to axonin-1 [Strongylocentrotus purpuratus] 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...PROTEIN --- Dm ---- 2e-040 NP_649461.2 CG1084-PA [Drosophila melanogaster] 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...PREDICTED - Ag ---- 8e-041 XP_311153.2 contactin-like putative cell adhesion molecule (AGAP000007-PA) [Anopheles gambiae str. PEST] 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PREDICTED - ?? ---- 8e-076 XP_001789283.1 PREDICTED: similar to Contactin-2 precursor (Axonin-1) (Axonal glycoprotein TAG-1) (Transient axonal glycoprotein 1) (TAX-1) [Bos taurus] 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...PROTEIN --- Dr ---- 9e-086 NP_851300.2 contactin 1a [Danio rerio] 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...PROTEIN --- Hs ---- 9e-108 NP_778203.1 contactin 1 isoform 2 precursor; glycoprotein gP135 [Homo sapiens] 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...PROTEIN --- Mm ---- 2e-108 NP_031753.1 contactin 1 [Mus musculus] 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...PREDICTED - Cf ---- 1e-109 XP_534836.2 PREDICTED: similar to contactin 1 isoform 2 precursor isoform 1 [Canis familiaris] 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...PROTEIN --- Bt ---- 7e-110 NP_776705.1 contactin 1 [Bos taurus] 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...PROTEIN --- Gg ---- 5e-113 NP_001004381.2 contactin 1 [Gallus gallus] 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...PROTEIN --- Xl ---- 2e-149 NP_001081205.1 contactin A [Xenopus laevis] 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Xl3.1-IMAGE:4743353.5 ATG---ATG---------------------------ATG ORF ... open reading frame ... 5 1 2 bld Eye1 IMAGE:4743353-IMAGp.IMAGp CTTGCACAGCACAAACAATTGTTGACAACTCTTCAGCTTCAGCTGATCTTGTAGTCAGAGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGTGGTATCAGAGTAGAAGAACTAAGAGATACTTCTGTAAAATTAACATGGAGTAGTGGAACCGACAATCACCAGCCAATTTCTAAGTATAACATCCAGGCAAGAAATATTTTGTCTGACGACTGGAAAGATGTAAAGACAGAAAATCCAAACATTGAAGGATATATGGAGATGGCAAGAGTTATAGATCTGATTCCTTGGATGGACTATGAATTCCGGGTTATAGCAACAAACACATTAGGAGTTGGAGAACCAAGCTTGCCATCCCCAAAAATAAGAACAGAGGGAGCTGCACCTATTGTAGCTCCTGCAGAAGTTGGCGGTGGTGGTGGAAGCAATCGTGAGTTAACAGTAACATGGCAGCCTTTGTCACGTGAATATCATTATGGTGATGGCTTTGGCTATGGTGTCGCCTTCAAGCCCTTCAATGTCAGGGAATGGAGAAAAGTTATTGTTTCCAACCCTGAAAGTGGTCACTATGTGCACAAGGATGACACCATAACTCCAGCAACACAGTTTCAAATAAAAGTAAAGGCCTTTAATAAAGTTGGAGAAGGTCCATACAGCAGCACTGTTGTAGTATACTCAGCAGAGGATGTGCCTACAGAAGCCCCAACGGCAGTAGTATACAATATATTGTCATCTACTGAAGTATCTGTTGCCTGGCATCCAGTTTATGAGAAATCTATTGAAGGTTACC 5 1 2 seed Eye1 out IMAGE:4743353.5p TGACAACTCTTCAGCTTCAGCTGATCTTGTAGTCAGAGGTCCCCCTGGTCCTCCAGGTGGTATCAGAGTAGAAGAACTAAGAGATACTTCTGTAAAATTAACATGGAGTAGTGGAACCGACAATCACCAGCCAATTTCTAAGTATAACATCCAGGCAAGAAATATTTTGTCTGACGACTGGAAAGATGTAAAGACAGAAAATCCAAACATTGAAGGATATATGGAGATGGCAAGAGTTATAGATCTGATTCCTTGGATGGACTATGAATTCCGGGTTATAGCAACAAACACATTAGGAGTTGGAGAACCAAGCTTGCCATCCCCAAAAATAAGAACAGAGGGAGCTGCACCTATTGTAGCTCCTGCAGAAGTTGGCGGTGGTGGTGGAAGCAATCGTGAGTTAACAGTAACATGGCAGCCTTTGTCACGTGAATATCATTATGGTGATGGCTTTGGCTATGGTGTCGCCTTCAAGCCCTTCAATGTCAGGGAATGGAGAAAAGTTATTGTTTCCAACCCTGAAAGTGGTCACTATGTGCACAAGGATGAC
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