Gurdon Institute Xenopus tropicalis EST Database |
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+ | Application in use by Guest User - 08 Aug 2022 - database INFO-PUBLIC | = |
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![]() | Estimated expression levels relative to total library clones. |
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![]() | Tissue specific expression levels | ![]() | ![]() |
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![]() | stage | ![]() |
1 | 5 | 10 | 15 | 20 | 25 | 30 | 35 | 40 | 45 | 50 | 55 | 60 | ![]() | tissue | ![]() |
Bod | Bone | Brn | Eye | Fat | Hrt | Int | Kid | Liv | Lun | Mus | Ova | Ovi | Panc | Ski | Spl | Sto | Te | Thy |
Related Clusters (none)
This cluster: approximate FL confidence score = 96% 1012072162 Xt7.1-TTbA004h14.3 - 114 ESTs .-160......-150......-140......-130......-120......-110......-100......-90.......-80.......-70.......-60.......-50.......-40.......-30.......-20.......-10.......0.........10........20........30........40........50........60........70........80........90........100.......110.......120.......130.......140.......150.......160.......170.......180.......190.......200.......210.......220.......230.......240.......250.......260.......270.......280.......290.......300.......310.......320.......330.......340.......350.......360.......370.......380.......390.......400.......410.......420.......430.......440.......450.......460.......470.......480.......490.......500.......510.......520.......530.......540.......550.......560.......570.......580.......590.......600.......610.......620.......630.......640.......650.......660.......670.......680.......690.......700.......710.......720.......730.......740.......750.......760.......770.......780.......790.......800.......810.......820.......830.......840.......850.......860.......870.......880.......890.......900.......910.......920.......930.......940.......950.......960.......970.......980.......990.......1000......1010......1020......1030......1040......1050......1060......1070......1080......1090......1100......1110......1120......1130......1140......1150......1160......1170......1180......1190......1200......1210......1220......1230......1240......1250......1260......1270......1280......1290......1300......1310......1320......1330......1340......1350......1360......1370......1380......1390......1400......1410......1420......1430......1440......1450......1460......1470......1480......1490......1500......1510......1520......1530......1540......1550......1560......1570......1580......1590......1600......1610......1620......1630......1640......1650......1660......1670......1680......1690......1700......1710......1720......1730......1740......1750......1760......1770......1780......1790......1800......1810......1820......1830......1840......1850......1860......1870......1880......1890......1900......1910......1920......1930......1940......1950......1960......1970......1980......1990......2000......2010......2020......2030......2040......2050......2060......2070......2080......2090......2100......2110......2120......2130......2140......2150......2160......2170......2180......2190......2200......2210......2220......2230......2240......2250......2260......2270......2280......2290......2300......2310......2320......2330......2340......2350......2360......2370......2380......2390......2400......2410......2420......2430......2440......2450......2460......2470......2480......2490......2500......2510......2520......2530......2540......2550......2560......2570......2580......2590......2600......2610......2620......2630......2640......2650......2660......2670......2680......2690......2700......2710......2720......2730......2740......2750......2760......2770......2780. ? ? ? ? ? ? ? ? Xt7.1-TTbA004h14.3 TGGAGTGCAAGGGTGTCAGGGCTGTGTTGCTCCTCGCTTGCTGCCTCCAGGCGGTTCGCGCCCAATTCCCGCGGTCCTGTGTGACGGTGGAGGCGCTCACTTCCAAGCGCTGCTGCCCCGCTCTGGGCTCCGACCTCAACAACGTATGCGGCTCCCTGGAGGGTCGGGGCCAGTGCACCCCTGTGGTTGTGGATGAGCGGCCCTGGAGCGGACCCTATACCCTGCGCAATGTGGATGATCGGGAGCGCTGGCCGCTGAAGTTCTTTAACTCCATCTGCAGGTGCACAGGGAACTTTGCAGGATTTAATTGTGGAGAATGCAAATTTGGCTGGACGGGACCCACTTGTGAGCAGCGGAAGCCCCCGGTTGTGCGAAAAAATATCCATTCATTGACTGCACAGGAGAGAACTCAGTTTTTGGATGCGCTGGATCAAGCCAAGAATACGATTCATCCTGACTATGTGATTGCTACTCAGCATTGGCTAAGCATTCTTGGGCCCAATGGAACAGAACCACAAGTGGCAAATACTAGCATCTACAACTATTTTGTGTGGCTTCATTACTACTCTGTTAGGGACACATTGCTAGGACCAGGACGTCCCTTCACTGCAATTGACTTCTCCCACCAGGGACCAGCGTTTGTAACTTGGCATCGTTACCACCTGTTACTGCTGGAAAGAGATCTTCAGAGAATGACTGGCAATGAGTCCTTTGCTTTACCATATTGGAACTTTGCAACTGGAAGGAATGAGTGTGATGTATGTACTGACGAGTTATTTGGTGCACCCAGACTGGACGACCCTAATCTGATAAGTGCTGGATCCCGATTCTCACGCTGGGGAATTGTGTGCAACAGTCTGAATGATTACAATCGGCTTGTGACCCTGTGTAATGGAACTAATGAAGGGTTTCTTCAGAGAAACCCTTTGGGTGGTGCAGAAGGAAGGCTTCCATCCATGGAAGATGTGCAGAAATGTCTCTCTTTGAATGAGTTTGATAATCCTCCCTTCTTCAGGAATTCTACTTTCAGCTTCCGGAATGCCCTTGAAGGATTTGATGAACCAGATGGAACATTAAATTCAACAGCAATGAGTCTACATAACCTTGTCCATTCTTTCTTAAATGGAACTAGCGCACAGTCACACTCTTCTGCCAATGACCCCATCTTTGTGGTGCTGCACTCTTTTACTGATGCTATCTTTGATGAGTGGATGAAACGTTTTCAGCCATCAGATGTTGCTTGGCCTCAAGAATTGGCTCCAATAGGGCACAACCGTATGTACAACATGGTGCCATTCTTTCCTCCTGTTACCAATGAAGAGCTTTTCCTACCAGCTGAACAGTTAGGCTATGTTTATTCTATCGACCTACCAGCTTCCATCGAAGACACCCGTGCAGTGGCTGTCCTGGTTGGGTCCACTATTGGTGGCATTCTTCTTGCCGTACTTTTACTTCTGCTTCTCCTAGTGCTCTTCATGCAAAGAAAACGTCAACAAGGATTTGAGCCATTAATGAATGCCACCTTTACCAACAAGAGATACACAGAAGATGCATAACATAACAATTGTAACAAAATAAACCGGTACTTCAGTGTGTACCATTATGTAAATATCTTATTAAACTGGTTATCACTATTAGGTTTTTGGAAAAAGCTTTTGTTTAAAACCTTAAAGATTTTCTTTGTTATTGTTTGAAAATCATATCCGGTTTATCCTGTATGATATGATAAATATTTTCGCACAGGTACACAAACATTATTTATGTGGGTACAGACTGACTACAATTCCTATCTCAATCAAACTACCTAAGTTCATTTTTTTTTTATTTGAAGAGGGAAATAATATCCATAGGCCATGTATTGGCTTCTTTAATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATGTTAACCATTTTCCCTGTGTTTTATGTGATGCCCTCTTTCCATACACACAAAATATATATTTAACACGGGTCTTTCAGCCCATAGCGCCATCTCGAGGCGGCCAGTGGAACGATGCACCCTGCCACTTTGGTTTTTAGTTTTAAAGGTTGGACACTCTCTACACTAGAAGAGCCGAAATTCCAATTTAAAAATCAGAATCCTAGCTCTTGAAATTACCAGAGGCGGCTTTTTGTTGCCCCTGGTAACTTCAGGGTCTCCGCCGACTGAGGCAGGTTTCTTAACATACTGCATGGCAGTGCCCCTGATTTAACATAATTAACTTTGCCTATTATAAGTAGCTTGAACAGTCCTGCACAAGGATACATATATAATAATTAGATATTCAAAAAGTAGAACTTTTTGTACAAGACCTTTTAAAGATTAAAATTCTGCTGACTTTACCAGCACATGTTGTCACAAACTACATGCAGTAGAAGTTGGTTCTAAAATTTTGAAAACCATTTCATGCTATACAGTAGGTATGTGACCTCTTGTACAGAATGCTTGGGACCTAGGGTTTTCTGGATAAGGGATCTTTCCTTAATTTTGATTACTATGCCTTAAGTCTAATAAAAGCA Xt7.1-CHK-1008222874 GCAAGGGTGTCAGGGCTGTGTTGCTCCTCGCTTGCTGCCTCCAGGCGGTTCGCGCCCAATTCCCGCGGTCCTGTGTGACGGTGGAGGCGCTCACTTCCAAGCGCTGCTGCCCCGCTCTGGGCTCCGACCTCAACAACGTATGCGGCTCCCTGGAGGGTCGGGGCCAGTGCACCCCTGTGGTTGTGGATGAGCGGCCCTGGAGCGGACCCTATACCCTGCGCAATGTGGATGATCGGGAGCGCTGGCCGCTGAAGTTCTTTAACTCCATCTGCAGGTGCACAGGGAACTTTGCAGGATTTAATTGTGGAGAATGCAAATTTGGCTGGACGGGACCCACTTGTGAGCAGCGGAAGCCCCCGGTTGTGCGAAAAAATATCCATTCATTGACTGCACAGGAGAGAACTCAGTTTTTGGATGCGCTGGATCAAGCCAAGAATACGATTCATCCTGACTATGTGATTGCTACTCAGCATTGGCTAAGCATTCTTGGGCCCAATGGAACAGAACCACAAGTGGCAAATACTAGCATCTACAACTATTTTGTGTGGCTTCATTACTACTCTGTTAGGGACACATTGCTAGGACCAGGACGTCCCTTCACTGCAATTGACTTCTCCCACCAGGGACCAGCGTTTGTAACTTGGCATCGTTACCACCTGTTACTGCTGGAAAGAGATCTTCAGAGAATGACTGGCAATGAGTCCTTTGCTTTACCATATTGGAACTTTGCAACTGGAAGGAATGAGTGTGATGTATGTACTGACGAGTTATTTGGTGCACCCAGACTGGACGACCCTAATCTGATAAGTGCTGGATCCCGATTCTCACGCTGGGGAATTGTGTGCAACAGTCTGAATGATTACAATCGGCTTGTGACCCTGTGTAATGGAACTAATGAAGGGTTTCTTCAGAGAAACCCTTTGGGTGGTGCAGAAGGAAGGCTTCCATCCATGGAAGATGTGCAGAAATGTCTCTCTTTGAATGAGTTTGATAATCCTCCCTTCTTCAGGAATTCTACTTTCAGCTTCCGGAATGCCCTTGAAGGATTTGATGAACCAGATGGAACATTAAATTCAACAGCAATGAGTCTACATAACCTTGTCCATTCTTTCTTAAATGGAACTAGCGCACAGTCACACTCTTCTGCCAATGACCCCATCTTTGTGGTGCTGCACTCTTTTACTGATGCTATCTTTGATGAGTGGATGAAACGTTTTCAGCCATCAGATGTTGCTTGGCCTCAAGAATTGGCTCCAATAGGGCACAACCGTATGTACAACATGGTGCCATTCTTTCCTCCTGTTACCAATGAAGAGCTTTTCCTACCAGCTGAACAGTTAGGCTATGTTTATTCTATCGACCTACCAGCTTCCATCGAAGACACCCGTGCAGTGGCTGTCCTGGTTGGGTCCACTATTGGTGGCATTCTTCTTGCCGTACTTTTACTTCTGCTTCTCCTAGTGCTCTTCATGCAAAGAAAACGTCAACAAGGATTTGAGCCATTAATGAATGCCACCTTTACCAACAAGAGATACACAGAAGATGCATAACATAACAATTGTAACAAAATAAACCGGTACTTCAGTGTGTACCATTATGTAAATATCTTATTAAACTGGTTATCACTATTAGGTTTTTGGAAAAAGCTTTTGTTTAAAACCTTAAAGATTTTCTTTGTTATTGTTTGAAAATCATATCCGGTTTATCCTGTATGATATGATAAATATTTTCGCACAGGTACACAAACATTATTTATGTGGGTACAGACTGACTACAATTCCTATCTCAATCAAACTACCTAAGTTCATTTTTTTTTTATTTGAAGAGGGAAATAATATCCATAGGCCATGTATTGGCTTCTTTAATATTAAAAAAAAAAAAAAAAxxxAAAAGAATGTTAACCATTTTCCCTGTGTTTTATGTGATGCCCTCTTTCCATACACACAAAATATATATTTAACACGGGTCTTTCAGCCCATAGCGCCATCTCGAGGCGGCCAGTGGAACGATGCACCCTGCCACTTTGGTTTTTAGTTTTAAAGGTTGGACACTCTCTACACTAGAAGAGCCGAAATTCCAATTTAAAAATCAGAATCCTAGCTCTTGAAATTACCAGAGGCGGCTTTTTGTTGCCCCTGGTAACTTCAGGGTCTCCGCCGACTGAGGCAGGTTTCTTAACATACTGCATGGCAGTGCCCCTGATTTAACATAATTAACTTTGCCTATTATAAGTAGCTTGAACAGTCCTGCACAAGGATACATATATAATAATTAGATATTCAAAAAGTAGAACTTTTTGTACAAGACCTTTTAAAGATTAAAATTCTGCTGACTTTACCAGCACATGTTGTCACAAACTACATGCAGTAGAAGTTGGTTCTAAAATTTTGAAAACCATTTCATGCTATACAGTAGGTATGTGACCTCTTGTACAGAATGCTTGGGACCTAGGGTTTTCTGGATAAGGGATCTTTCCTTAATTTTGATTACTATGCCTTAAGTCTAATAAAAGCATATAAA consensus depths 16 17 28 29 30 30 31 31 31 31 31 32 31 32 32 33 32 33 33 33 34 34 34 34 34 34 34 34 34 34 34 34 36 36 36 36 36 36 36 36 36 36 36 36 36 37 36 37 37 37 37 37 37 37 37 37 37 37 37 37 37 37 37 37 38 38 38 38 38 39 39 39 39 39 39 39 39 39 39 39 38 39 38 40 38 39 38 39 38 39 38 39 38 39 37 38 38 39 37 39 36 38 35 37 33 36 33 35 33 35 34 36 32 35 33 36 34 36 31 35 31 34 31 34 32 35 31 32 32 33 32 33 27 32 29 30 27 27 24 26 24 27 25 27 23 24 22 24 24 25 25 27 24 26 26 28 26 28 26 28 26 28 30 33 30 34 31 34 31 34 32 36 35 37 36 38 37 39 39 41 40 41 40 41 41 42 40 41 42 42 41 43 46 47 46 47 50 50 49 49 50 50 51 51 51 51 53 53 52 53 53 53 53 53 53 53 52 53 53 53 52 54 52 54 53 54 50 54 52 53 49 55 54 56 51 56 53 56 52 56 52 56 49 56 52 55 50 55 48 53 50 55 51 55 51 55 51 54 51 54 47 51 46 50 46 50 45 50 44 49 41 48 20 32 20 25 21 23 21 22 21 22 21 22 21 22 21 22 21 22 23 24 23 24 23 24 22 23 22 23 22 23 22 23 21 24 21 24 19 24 19 25 7 15 9 12 4 9 4 9 4 9 4 9 4 9 5 9 5 9 5 8 5 8 5 8 5 8 5 8 6 9 6 9 6 9 6 9 7 9 6 9 7 9 7 9 7 9 7 9 7 9 7 9 6 9 7 9 7 9 7 9 7 9 7 9 7 9 7 9 7 9 7 9 7 9 7 9 6 9 7 9 8 10 8 10 8 9 8 9 8 9 8 9 8 9 6 9 6 9 5 8 4 7 4 7 4 7 3 7 SNP --C--------- SNP -A---------- SNP ----T------- SNP ----G------- SNP ---T-------- SNP -G---------- SNP -T---------- SNP -----T------ SNP --T--------- SNP ---------A-- SNP ----------C- BLH ATG -1 1538 PROTEIN --- Ce ---- 1e-007 NP_499836.1 tyrosinase family member (77.8 kD) (3O835) [Caenorhabditis elegans] ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------=============================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================== PROTEIN === Br ==== 4e-018 AAO13798.1 TYROSINASE-RELATED PROTEIN 1 [Branchiostoma belcheri tsingtaunese] ==================================================================================================================================================================================================================== PROTEIN --- Bf ---- 3e-067 AAM18867.1 unknown [Branchiostoma floridae] ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------============================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================= PROTEIN --- ?? ---= 2e-149 NP_001080492.1 tyrosinase-related protein 1 [Xenopus laevis] =========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================== PROTEIN === Dr ==== 0 NP_571630.1 dopachrome tautomerase [Danio rerio] ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================== PROTEIN --- Mm ---- 0 NP_034154.1 dopachrome tautomerase; tyrosinase-related protein-2 [Mus musculus] ============================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================= PROTEIN --- Hs ---- 0 NP_001913.2 dopachrome tautomerase (dopachrome delta-isomerase, tyrosine-related protein 2);Dopachrome tautomerase (dopachrome delta-isomerase; tyrosinase-related protein2) [Homo sapiens] ================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================= PROTEIN --- Gg ---- 0 NP_990266.1 tyrosinase-related protein-2 [Gallus gallus] =================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================== PROTEIN -== Xl ==== 0 AAH97647.1 Unknown (protein for IMAGE:5572665) [Xenopus laevis] ============================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================= PROTEIN === Xt ==== 0 CAJ83137.1 dopachrome tautomerase (dopachrome delta-isomerase, tyrosine-related protein 2) [Xenopus tropicalis] =================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================== Xt7.1-TTbA004h14.3 ATG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATG---------------------------------------------------------------ATG------ATG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATG---------------------------------ATG---------------------------------------TAA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGA------------------------TGA---------------------------------------ATG------------------------------------------TAA------------------TGA---------TAA------TAG---ATG------------TAA---TAA---------------------------TAA------------------ATGTGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATG---------------TAA------TAA------------TAA------TGA------------------------------------------------------------------------------TAA------------------------------------------------------------------------------------------------ATGTGA---------------------------------------TAA------------TAA---TGA ORF ... open reading frame ] 5 1 2 bld Te5 in CAAO7705.5p GGCATGAGTGGCCCCAGCCTGCGTGTTGGCAGATTAATTGCATGTAATTAGACATGAGACATTTGGCCTCCCAGTGAATGGCTGATTGTGAGTCCGTGTGCATGTGACACACACTAGCCGATAAGTAGCGGGGCCCGCCAGTGAGAGGAGCAGAGCGGAGATGGAGTGCAAGGGTGTCAGGGCTGTGTTGCTCCTCGCTTGCTGCCTCCAGGCGGTTCGCGCCCAATTCCCGCGGTCCTGTGTGACGGTGGAGGCGCTCACTTCCAAGCGCTGCTGCCCCGCTCTGGGCTCCGACCTCAACAACGTATGCGGCTCCCTGGAGGGTCGGGGCCAGTGCACCCCTGTGGTTGTGGATGAGCGGCCCTGGAGCGGACCCTATACCCTGCGCAATGTGGATGATCGGGAGCGCTGGCCGCTGAAGTTCTTTAACTCCATCTGCAGGTGCACAGGGAACTTTGCAGGATTTAATTGTGGAGAATGCAAATTTGGCTGGACGGGACCCACTTGTGAGCAGCGGAAGCCCCCGGTTGTGCGAAAAAATATCCATTCATTGACTGCACAGGAGAGAACTCAGTTTTTGGATGCGCTGGATCAAGCCAAGAATACGATTCATCCTGACTATGTGATTGCTACTCAGCATTGGCTAAGCATTCTTGGGCCCAATGGAACAGAACCACAAGTGGCAAATACTAGCATCTACAACTATTTTGTGTGGCTTCATTACTACTCTGTTAGGGACACATTGCTAGGACCAGGACGTCCCTTCACTGCAATTGACTTCTCCCACCAGGGACCAGCGTTTGTAACTTGGCATCGTTACCACCTGTTACTGC 5 1 2 bld Egg 5g3 in TEgg004d07.p1kSP6 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