Gurdon Institute Xenopus tropicalis EST Database |
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+ | Application in use by Guest User - 18 Jan 2021 - database INFO-PUBLIC | = |
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![]() | Stage specific expression levels | ![]() | ![]() |
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Bod | Bone | Brn | Eye | Fat | Hrt | Int | Kid | Liv | Lun | Mus | Ova | Ovi | Panc | Ski | Spl | Sto | Te | Thy |
Related Clusters (none)
This cluster: approximate FL confidence score = 97% 1012073835 Xt7.1-TNeu069m11.3 - 71 ESTs -20.......-10.......0.........10........20........30........40........50........60........70........80........90........100.......110.......120.......130.......140.......150.......160.......170.......180.......190.......200.......210.......220.......230.......240.......250.......260.......270.......280.......290.......300.......310.......320.......330.......340.......350.......360.......370.......380.......390.......400.......410.......420.......430.......440.......450.......460.......470.......480.......490.......500.......510.......520.......530.......540.......550.......560.......570.......580.......590.......600.......610.......620.......630.......640.......650.......660.......670.......680.......690.......700.......710.......720.......730.......740.......750.......760.......770.......780.......790.......800.......810.......820.......830.......840.......850.......860.......870.......880.......890.......900.......910.......920.......930.......940.......950.......960.......970.......980.......990.......1000......1010......1020......1030......1040......1050......1060......1070......1080......1090......1100......1110......1120......1130......1140......1150......1160......1170......1180......1190......1200......1210......1220......1230......1240......1250......1260......1270......1280......1290......1300......1310......1320......1330......1340......1350......1360......1370......1380......1390......1400......1410......1420......1430......1440......1450......1460......1470......1480......1490......1500......1510......1520......1530......1540......1550......1560......1570......1580......1590......1600......1610......1620......1630......1640......1650......1660......1670......1680......1690......1700......1710......1720......1730......1740......1750......1760......1770......1780......1790......1800......1810......1820......1830......1840......1850......1860......1870......1880......1890......1900......1910......1920......1930......1940......1950......1960......1970......1980......1990......2000......2010......2020......2030......2040......2050......2060......2070......2080......2090......2100......2110......2120......2130......2140......2150......2160......2170......2180......2190......2200......2210......2220......2230......2240......2250......2260......2270......2280......2290......2300......2310......2320......2330......2340......2350......2360......2370......2380......2390......2400......2410......2420......2430......2440......2450......2460......2470......2480......2490......2500......2510......2520......2530......2540......2550......2560......2570......2580......2590......2600......2610......2620......2630......2640......2650......2660......2670......2680......2690......2700......2710......2720......2730......2740......2750......2760......2770......2780......2790......2800......2810......2820......2830......2840......2850......2860......2870......2880......2890......2900......2910......2920......2930......2940 ? ? ? ? ? ? ? ? Xt7.1-TNeu069m11.3 GCCCTGTGAGATCCCTCCTGCTGCTCTCAGAGCTGGGAGTGTGAGTGAATGTAGCCCGCAGAGCCAATGAGCTGGGACCGGATGCGATATATCCTCTGGGACAACAACTGCTCTGTTCCTCCTCACTTCCACATGACGCCATTTAGCGCTGCTGCTGCTGCCTAGGATCCCGGGAGCGGAGCAGCTCAGTCACATCGCCAGTATCCGGCAGAGTGCAAGCTCCGCTGTCACATGCACTAGAGGCGCCCGGTGCAGCACTTTCCTTGCACACCAAGCTCTTGGGATTTCTCGCTACTTTCATATTCATTTCACTTGCTGCAAGTTTAGAAGTTTGATCGCGGAGTCCGGGGATTGTACTTAGCTGCGCTACAACTCAACTTAGTGGATACAAGGATCGCTCTGGAATAGGGGAACCTGCAACCCTGTGTCATGTTTTCTGTGACCCTTCCTATTGGGCTTGGGGACCGCTGGCTGAAATTTGCCCGGAGCGAAACACGGGGCTAGCCCCATTTGCCCAGTAGGGCTCCCGGCCGGGGCGAGGAGGTCACGCAGGATTTCAGATGTGTTCTCAGCCCACAGGTGTGAAAACTCTTCAGAGTACTGATGGAGACGAGAGTACAAAATGGCAACGTATCCCAGCCTTTGCTCCCGGCTCGGCGTGACAGTGAAAGATTACATAGTGATGCTGACCCACGTGAAATTCTGACACAACAAGTTCATGTTTTGTCTTTGGAACAAATAAGAGCCATAAGAAACACTAATGAATACACAGAAGGGCCTACAGTGGCTCCACGCCCTGTGATTAAATCTGCTCCACGACAGACTACGCCACACAAAAATGAAAGAATACATGTGGTAAATGAGCAGCGACCTTTTGTCAGGAGTCCACTTCCACCAATGCATTCCTTGTCTCAGGCACCTTTGTCACGATCAGTCGGTACAGTCACTTCATCTTGCCGGAGCAATACGAGGACAAGTAGCAGTTCTACAGAGCAAAGGCTTCTTGCGCCACCATTTACATCTTCAGGGTTGGTTGCAGACCGAATAATAAGAGTACAACCCAAACCTGAGCTGAAATCAGACATTTTAAAGCCCTCTAGTAAAGAGGAATTGGGCTTACATTCATTAAGGTGTGAGGACTGTGGGAAATGTAAGTGCCAAGAATGCACTTATCCAAGGACTCTCCCATCTTGTTGGATTTGTGACAAGCAGTGCCTTTGCTCAGCCCAGGAAGTTGTTGACTATGGAACCTGTGCTTGCTGTGTGAAGTGCCTATTCTATCACTGTTCAAATGATGACGAGGATAATTGTGCAGACAACCCATGTTCTTGCAGTCAGTCCCACTGCTGCACTCGATGGTCTGCCATTGGTGTCATGGCCTTGTTCTTGCCTTGTTTGTGGTGTTACCTTCCAGCCAAGGGTTGCCTTAAATTGTGCCAGGGCTGTTACGACCGCACAAATAGACCCGGATGTCGCTGCAAAAGATCAAACACAGTTTGCCTTAAAGTTCCACACCTTCAGCCTAGGAACTTAGAAAAACCAACATAGCACAGGTGAACGGACATTTATAAAGAACATAACTTCCTTTTAACACTCAAATGCAACCATCTTGTTACATTTAGGAAAAAAAGCTTTGGGATAGGATTGCCTGTTTGCAGTGAAATACTTATGCATCAACGGATTTAGGCTTAATAGAGAACCTCTAATAAAGCTTACAGTAGGATTTGGTGTTCTGTGACGACTATTGTGTACGCTATTGCAGCACAGACACTCCTATGTAACATTGTATTGTTTGTGAATAGTACTTGGAACATTTGTAAAATTTGCAAATGGCTTTTTTTGTCAGAGATATTATGTTATATTTTTGTACATAAACCATATTTACAACTGTGAAAAAAGTGCCATTTTTTGATGGCATGGTCACAAAATTTACTAATGTACATTCAAAAGAATGTGAATCAATCAGTATGGTTAGATTGTCCTTCGCTTTCTGGAACTTTTAATATTACCAGACTTCTATTCTTTGGATCTTATGTATATTGTACAGTTACACTGTAAGATTCAGCCTTTATTTTCTAATGTTTCAATATTGTTTAGTGTAAAGTATATTTATTTGAAGTTTTATTATTTTATAAAGAGAAATATTTATTTTATGAAGCATCTTACAAATGTCTCCCCTTTTTATGATGTCAGTTTCTGCAAATTGGGGGTGACTGAGACATATGTTCACTATAAAATAGAAATATATTAACGTCT Xt7.1-CHK-1008224320 TGAGATCCCTCCTGCTGCTCTCAGAGCTGGGAGTGTGAGTGAATGTAGCCCGCAGAGCCAATGAGCTGGGACCGGATGCGATATATCCTCTGGGACAACAACTGCTCTGTTCCTCCTCACTTCCACATGACGCCATTTAGCGCTGCTGCTGCTGCCTAGGATCCCGGGAGCGGAGCAGCTCAGTCACATCGCCAGTATCCGGCAGAGTGCAAGCTCCGCTGTCACATGCACTAGAGGCGCCCGGTGCAGCACTTTCCTTGCACACCAAGCTCTTGGGATTTCTCGCTACTTTCATATTCATTTCACTTGCTGCAAGTTTAGAAGTTTGATCGCGGAGTCCGGGGATTGTACTTAGCTGCGCTACAACTCAACTTAGTGGATACAAGGATCGCTCTGGAATAGGGGAACCTGCAACCCTGTGTCATGTTTTCTGTGACCCTTCCTATTGGGCTTGGGGACCGCTGGCTGAAATTTGCCCGGAGCGAAACACGGGGCTAGCCCCATTTGCCCAGTAGGGCTCCCGGCCGGGGCGAGGAGGTCACGCAGGATTTCAGATGTGTTCTCAGCCCACAGGTGTGAAAACTCTTCAGAGTACTGATGGAGACGAGAGTACAAAATGGCAACGTATCCCAGCCTTTGCTCCCGGCTCGGCGTGACAGTGAAAGATTACATAGTGATGCTGACCCACGTGAAATTCTGACACAACAAGTTCATGTTTTGTCTTTGGAACAAATAAGAGCCATAAGAAACACTAATGAATACACAGAAGGGCCTACAGTGGCTCCACGCCCTGTGATTAAATCTGCTCCACGACAGACTACGCCACACAAAAATGAAAGAATACATGTGGTAAATGAGCAGCGACCTTTTGTCAGGAGTCCACTTCCACCAATGCATTCCTTGTCTCAGGCACCTTTGTCACGATCAGTCGGTACAGTCACTTCATCTTGCCGGAGCAATACGAGGACAAGTAGCAGTTCTACAGAGCAAAGGCTTCTTGCGCCACCATTTACATCTTCAGGGTTGGTTGCAGACCGAATAATAAGAGTACAACCCAAACCTGAGCTGAAATCAGACATTTTAAAGCCCTCTAGTAAAGAGGAATTGGGCTTACATTCATTAAGGTGTGAGGACTGTGGGAAATGTAAGTGCCAAGAATGCACTTATCCAAGGACTCTCCCATCTTGTTGGATTTGTGACAAGCAGTGCCTTTGCTCAGCCCAGGAAGTTGTTGACTATGGAACCTGTGCTTGCTGTGTGAAGTGCCTATTCTATCACTGTTCAAATGATGACGAGGATAATTGTGCAGACAACCCATGTTCTTGCAGTCAGTCCCACTGCTGCACTCGATGGTCTGCCATTGGTGTCATGGCCTTGTTCTTGCCTTGTTTGTGGTGTTACCTTCCAGCCAAGGGTTGCCTTAAATTGTGCCAGGGCTGTTACGACCGCACAAATAGACCCGGATGTCGCTGCAAAAGATCAAACACAGTTTGCCTTAAAGTTCCACACCTTCAGCCTAGGAACTTAGAAAAACCAACATAGCACAGGTGAACGGACATTTATAAAGAACATAACTTCCTTTTAACACTCAAATGCAACCATCTTGTTACATTTAGGAAAAAAAGCTTTGGGATAGGATTGCCTGTTTGCAGTGAAATACTTATGCATCAACGGATTTAGGCTTAATAGAGAACCTCTAATAAAGCTTACAGTAGGATTTGGTGTTCTGTGACGACTATTGTGTACGCTATTGCAGCACAGACACTCCTATGTAACATTGTATTGTTTGTGAATAGTACTTGGAACATTTGTAAAATTTGCAAATGGCTTTTTTTGTCAGAGATATTATGTTATATTTTTGTACATAAACCATATTTACAACTGTGAAAAAAGTGCCATTTTTTGATGGCATGGTCACAAAATTTACTAATGTACATTCAAAAGAATGTGAATCAATCAGTATGGTTAGATTGTCCTTCGCTTTCTGGAACTTTTAATATTACCAGACTTCTATTCTTTGGATCTTATGTATATTGTACAGTTACACTGTAAGATTCAGCCTTTATTTTCTAATGTTTCAATATTGTTTAGTGTAAAGTATATTTATTTGAAGTTTTATTATTTTATAAAGAGAAATATTTATTTTATGAAGCATCTTACAAATGTCTCCCCTTTTTATGATGTCAGTTTCTGCAAATTGGGGGTGACTGAGACATATGTTCACTATAAAATAGAAATATATTAACGTCTGAAAAC consensus depths 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 3 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 4 4 6 6 8 8 10 10 12 13 14 14 14 14 15 15 16 16 16 16 16 16 17 17 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 18 19 19 20 19 20 20 21 20 21 20 21 20 21 20 21 20 21 20 22 20 22 20 22 19 21 19 21 18 22 18 22 18 22 18 21 19 22 19 22 19 22 19 22 19 22 19 22 21 23 21 23 21 23 22 24 22 24 22 24 23 25 23 25 24 25 24 25 24 25 23 24 22 23 22 23 20 21 20 20 21 21 20 20 20 20 19 19 17 18 17 17 17 17 16 16 14 15 16 16 15 15 15 15 15 15 16 16 16 16 16 16 14 15 14 15 14 14 13 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 14 14 14 14 13 14 13 15 13 15 13 15 13 15 13 15 13 14 13 14 13 14 15 16 15 16 15 16 15 16 17 18 16 18 16 18 15 17 15 17 17 19 19 20 21 23 23 27 23 28 22 27 22 27 22 27 20 25 22 27 23 29 24 31 26 32 26 34 26 34 27 35 26 35 25 34 26 35 27 36 27 37 29 38 29 38 29 38 28 39 28 39 28 39 27 38 27 38 26 38 26 38 26 38 26 38 26 38 26 38 26 38 31 37 31 37 30 37 30 37 29 36 29 36 28 35 28 34 27 33 27 33 27 33 26 33 27 33 26 32 26 31 25 31 24 31 26 31 26 31 26 31 24 30 25 30 25 30 24 30 24 30 24 30 22 27 21 25 21 23 22 24 21 24 21 24 19 23 19 23 19 23 VAR TTCAGATGTGTTCTCAGCCCACAGGTGTGAAAACTC SNP ---C-------- SNP ---------G-T SNP ----------T- SNP ---G-------- SNP -----------T BLH ATG 603 1033 BLH MIN 603 126 BLH MPR 165 126 BLH OVR 603 567 CDS MIN 603 126 ORF LNG 603 42 PREDICTED - Sp ---- 1e-011 XP_785660.2 PREDICTED: similar to sprouty-related, EVH1 domain containing 2 [Strongylocentrotus purpuratus] --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================== PROTEIN --- Dm ---- 3e-041 NP_523902.2 sprouty CG1921-PB [Drosophila melanogaster] ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------============================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================ PROTEIN === Dr ==== 5e-083 NP_001003842.2 sprouty homolog 2 [Danio rerio] ================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================= PROTEIN === Mm ==== 8e-138 NP_036027.1 sprouty homolog 2 [Mus musculus] ================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================== PROTEIN === Hs ==== 3e-139 NP_005833.1 sprouty 2 [Homo sapiens] ========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================== PROTEIN === Gg ==== 2e-140 NP_990131.1 sprouty 2 [Gallus gallus] ========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================= PROTEIN === Xl ==== 1e-178 AAK51356.1 sprouty2 [Xenopus laevis] ========================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================== PROTEIN === ?? ==== 1e-178 NP_001082238.1 sprouty 2 [Xenopus laevis] ===================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================== PROTEIN === Xt ==== 0 AAU43764.1 Sprouty2 [Xenopus tropicalis] ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================== Xt7.1-TNeu069m11.3 TGA------------------------------------TGAATGTAG------------ATG------------ATG------------------------------------------------ATG---------------------------TAG------------------------------------------------------------------ATG---TAG------------------------------------------------------------------------------------TAG------------------------------------------------------------------------------TAG---------------------ATG---------------------------------------------------------------------TAG------------------------------------------------------------------------------TGA------------------ATG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAG------TGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATG------------TAG---TAATAG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGA------------------ATG---------------------ATG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAA------------------TAA---------------TAG---------------------------------------------------------------------------------------TGA---------------------------TGA---------------TAA ORF [ open reading frame ] 5 1 1 Gas1 FL IMAGE:5308295.FL-MGC GCTCCGCTGTCACATGCACTAGAGGCGCCCGGTGCAGCACTTTCCTTGCACACCAAGCTCTTGGGATTTCTCGCTACTTTCATATTCATTTCACTTGCTGCAAGTTTAGAAGTTTGATCGCGGAGTCCGGGGATTGTACTTAGCTGCGCTACAACTCAACTTAGTGGATACAAGGATCGCTCTGGAATAGGGGAACCTGCAACCCCGTGTCATGTTTTCTGTGACCCTTCCTATTGGGCTTGGGGACCGCTGGCTGAAATTTGCCCGGAGCGAAACACGGGGCTAGCCCCATTTGCCCAGTAGGGCTCCCGGCCGGGGCGAGGAGGTCACGCAGGATTTCAGATGTGTTCTCAGCCCACAGGTGTGAAAACTCTTCAGAGTACTGATGGAGACGAGAGTACAAAATGGCAACGTATCCCAGCCTTTGCTCCCGGCTCGGCGTGACAGTGAAAGATTACATAGTGATGCTGACCCACGTGAAATTCTGACACAACAAGTTCATGTTTTGTCTTTGGAACAAATAAGAGCCATAAGAAACACTAATGAATACACAGAAGGGCCTACAGTGGCTCCACGCCCTGTGATTAAATCTGCTCCACGACAGACTACGCCACACAAAAATGAAAGAATACATGTGGTAAATGAGCAGCGACCTTTTGTCAGGAGTCCACTTCCACCAATGCATTCCTTGTCTCAGGCACCTTTGTCACGATCAGTCGGTACAGTCACTTCATCTTGCCGGAGCAATACGAGGACAAGTAGCAGTTCTACAGAGCAAAGGCTTCTTGTGCCACCATTTACATCTTCAGGGTTGGTTGCAGACCGAATAATAAGAGTACAACCCAAACCTGAGCTGAAATCAGACATTTTAAAGCCCTCTAGTAAAGAGGAATTGGGCTTACATTCATTAAGGTGTGAGGACTGTGGGAAATGTAAGTGCCAAGAATGCACTTATCCAAGGACTCTCCCATCTTGTTGGATTTGTGACAAGCAGTGCCTTTGCTCAGCCCAGGAAGTTGTTGACTATGGAACCTGTGCTTGCTGTGTGAAGTGCCTATTCTATCACTGTTCAAATGATGACGAGGATAATTGTGCAGACAACCCATGTTCTTGCAGTCAGTCCCACTGCTGCACTCGATGGTCTGCCATTGGTGTCATGGCCTTGTTCTTGCCTTGTTTGTGGTGTTACCTTCCAGCCAAGGGTTGCCTTAAATTGTGCCAGGGCTGTTACGACCGCACAAATAGACCCGGATGTCGCTGCAAAAGATCAAACACAGTTTGCCTTAAAGTTCCACACCTTCAGCCTAGGAACTTAGAAAAACCAACATAGCACAGGTGAACGGACGTTTATAAAGAACATAACTTCCTTTTAACACTCAAATGCAACCATCTTGTTACATTTAGGAAAAAAAGCTTTGGGATAGGATTGCCTGTTTGCAGTGAAATACTTATGCATCAACGGATTTAGGCTTAATAGAGAACCTCTAATAAAGCTTACAGTAGGATTTGGTGTTCTGTGACGACTATTGTGTACGCTATTGCAGCACAGACACTCCTATGTAACATTGTATTGTTTGTGAATAGTACTTGGAACATTTGTAAAATTTGCAAATGGCTTTTTTTTGTCAGAGATATTATGTTATATTTTTGTACATAAACCATATTTACAACTGTGAAAAAAGTGCCATTTTTTGATGGCATGGTCACAAAATTTACTAATGTACATTCAAAAGAATGTGAATCAATCAGTATGGTTAGATTGTCCTTCGCTTTCTGGAACTTTTAATATTACCAGACTTCTATTCTTTGGATCTTATGTATATTGTACAGTTACACTGTAAGATTCAGCCTTTATTTTCTAATGTTTCAATATTGTTTAGTGTAAAGTATATTTATTTGAAGTTTTATTATTTTATAAAGAGAAATATTTATTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 0 1 1 Egg FL TEgg014j04.FL-Sanger 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