Gurdon Institute Xenopus tropicalis EST Database
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Application in use by Guest User - 08 Mar 2021 - database INFO-PUBLIC
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By Clone or Sequence Name
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Related Clusters
CS% VC Transcript Size Type Links % In % Out Identified Blast Description.
1 2.0 0Xt7.1-CABI6906.5 18 END 1 2 5 (no blast hit)
This cluster: approximate FL confidence score = 97%
1012074330 Xt7.1-CABD6323.3.5 - 50 ESTs
.....-20.......-10.......0.........10........20........30........40........50........60........70........80........90........100.......110.......120.......130.......140.......150.......160.......170.......180.......190.......200.......210.......220.......230.......240.......250.......260.......270.......280.......290.......300.......310.......320.......330.......340.......350.......360.......370.......380.......390.......400.......410.......420.......430.......440.......450.......460.......470.......480.......490.......500.......510.......520.......530.......540.......550.......560.......570.......580.......590.......600.......610.......620.......630.......640.......650.......660.......670.......680.......690.......700.......710.......720.......730.......740.......750.......760.......770.......780.......790.......800.......810.......820.......830.......840.......850.......860.......870.......880.......890.......900.......910.......920.......930.......940.......950.......960.......970.......980.......990.......1000......1010......1020......1030......1040......1050......1060......1070......1080......1090......1100......1110......1120......1130......1140......1150......1160......1170......1180......1190......1200......1210......1220......1230......1240......1250......1260......1270......1280......1290......1300......1310......1320......1330......1340......1350......1360......1370......1380......1390......1400......1410......1420......1430......1440......1450......1460......1470......1480......1490......1500......1510......1520......1530......1540......1550......1560......1570......1580......1590......1600......1610......1620......1630......1640......1650......1660......1670......1680......1690......1700......1710......1720......1730......1740......1750......1760......1770......1780......1790......1800......1810......1820......1830......1840......1850......1860......1870......1880......1890......1900......1910......1920......1930......1940......1950......1960......1970......1980......1990......2000......2010......2020......2030......2040......2050......2060......2070......2080......2090......2100......2110......2120......2130......2140......2150......2160......2170......2180......2190......2200......2210......2220......2230......2240......2250......2260......2270......2280......2290......2300......2310......2320......2330......2340......2350......2360......2370......2380......2390......2400......2410......2420......2430......2440......2450......2460......2470......2480......2490......2500......2510......2520......2530......2540......2550......2560......2570......2580......2590......2600......2610......2620......2630......2640......2650......2660......2670......
? ? ? ? ? ? ? ?
Xt7.1-CABD6323.3.5 TTGACCTACTAACACAGATCTGTAGAGCAGCAGCAGCAGGCTGCAGACTGGAGCGGGCAGAGACACTGATACACGCACGCATGCACACACGTACACACATAAGCACTGCACAGGAGGCGCTGCTTGACACTCCAGCGTTGTGATTTTTGTTTTATTCCCTTGTTGTTGGCATATCTGATCACATCAACTCCCAGGTACTGGCCACCCATGCCTGGAAAGGAGCAAGTGAAGTTCTTCCGTTAAATAAGAGCAAAGATGCCTATGAACTGATGCAAGCGCTAATGCAGGTCAAATTTTTGTTCCTGAGCATATAACGGAAATGGTTACAACCTGGCTGTCATGAGGCCATGAAGGAAATATTACCAGCAGATGGAATTTAATCTAATTACAAGCTTCAAGTTGACGTGAAATTGCTCTTTTTAGGAGCTGCAGAAGGTTTCTAACTCCACTTCCTTCTCATGCAGCTGAGAAAAATGCCAACCATTAAAAGAGAGCAGGAATGTGCAGATTCACGCAACAATATGGAAAATATTCTTGTTCTTAGTTCAAACATACCAGACATGTCAGAATCCATGGACTCCAGCAATGATATGTTGTACAGCGAAGGGGCACCAGCGAAAAACAAAAACTCCTCATGTCGGAGGAAAAGGGAATTTATCCCAGATGAAAAGAAAGATGCTATGTACTGGGAAAAAAGACGGAAAAACAATGAAGCTGCAAAAAGGTCGAGAGAAAAACGGAGATTAAATGACATGGTTTTGGAAAATAAACTTATTGCACTAGGAGAGGAGAATGCCAGTCTGAAAACAGAACTGCTGTCTTTAAAACTTAAATTTGGCTTGATTAGTTCTGCTTCCTATGCCCAAGAAATACAAAAGGTCACAACCTCCACTGCAATGTATTTTCAGGAATACTCATCTTCCAAACCAAATGTAATGTCGTATAACAGTGATCATGAACATTCTGTAATGACCAGCAGTTGTATTTCAGTTATCAAGCACTCCCCACAAAGCTCTCTGTCTGATGTGTCTGAGGCATCATCCGTGGAGCATGTTCAGCCGAGCACTGTCCAGAGCAACTGCAGAAGTACTGATATAAACTTCCAAAGAATTAAACAGGAACCTATGGAAAGGGAGAACTTTTCTAGAGATGCCAGAGAAGACAGTAACACTTTCCAAGGCTCTATATATACCAATTATATTGGAAACACATTTTCTGGGTATTCACATTCTCCTCCACTTCTTCACATAAACAGATCGTCGAGTAACTCTCCGAGAACATCAGAAGCAGATGAAGGTGTGGTAGGAAAGACGTCTGATGGTGAGGATGAACAGCAGGTTCCTAAAGGTCCCATTCATTCCCCAGTTGAACTTAAAAACGGGCACACGACAATCATAAAGGTTCCAGAAGTGAACTCCTCTGCATTACCTCACAAGCTCCGCATAAAAGCAAAGGCTATGCAGATTAAAGTAGAAGCACTGGAAAGCGAACTTAATAGCACTCAAAAACTGACCCTGCCAATTGATATGTCCTCAAAGCGGCACTTACAGCTGGAAAAACACAACAGTGAAACCATGGTACATTCTTCTTTGTCACCTTTATCAGTTCAAGTAACTAATATACAGGACTGGCCACTAAAACCAGGTCAGTGGCACCACAGGGAACTTGATAAAATTCCAAGTGTTTGTAAAACATCTGGGATTGTGGATATAAAAGACAATGTCTTCAAAGCCTCTGAGTCAGAGAGCTTATATTTAAAGCAAGGTATTGCAAATCTATCTGCTGAGGTTGCAACCCTTAAAAGACTTATAGTAACCCAGGAAATCTGTGCATCCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGATTTTTTCATGATATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTCAAGTAATGATGTCTACTTAATATTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGATCACTATGCCTTGTGTACAGATAGGTAGCCAATGCAAGGCTGTAAATATCTTTAAACATTATTTTTGCCAGTCTGTTATAAATTGTGAAAGTTACCAGTTAAATAAAGTATTGGTGAAAAATATGTGCCTCGGGTTTGTATTAGAAATTTATTAGACACAAATAATAATGTTTGCGCTTTGGGATCCGCAACTATATTGCCAATGTTCTTCTTTACATCAGACTCCAGCATCAACTATGAAAGAAGCTGATAGAAACATGTTAATGTAATGACCCCATTACTAATGCAATTATTGTCATTGTTATCATCAGAAACTTATATTCAAGTAAGAGCTTAATAGCTCCCAGACCAATACCTTTTGTAGCTTGAGACCAGGTATTCAAGTCACCCCAAATCCCCATCCCCTAGGGCAGCTCCATGAATGCCAGTGTTCAGGCTCTTTCAAAGAGCTGTCACTCAGATATGTGGCTATTGCCCATGTGGGCATGGCGGACACATGTGGAGGCTCATTTATCAAAATTCAAACTTTTGTACTTTTTGTGGACTGCTCTCCCATGAAAAAACTCAGAAATTAAAAAAGCACGAATGTTGACTTATTTATTTAAAG
Xt7.1-CHK-1008225758 TACTAACACAGATCTGTAGAGCAGCAGCAGCAGGCTGCAGACTGGAGCGGGCAGAGACACTGATACACGCACGCATGCACACACGTACACACATAAGCACTGCACAGGAGGCGCTGCTTGACACTCCAGCGTTGTGATTTTTGTTTTATTCCCTTGTTGTTGGCATATCTGATCACATCAACTCCCAGGTACTGGCCACCCATGCCTGGAAAGGAGCAAGTGAAGTTCTTCCGTTAAATAAGAGCAAAGATGCCTATGAACTGATGCAAGCGCTAATGCAGGTCAAATTTTTGTTCCTGAGCATATAACGGAAATGGTTACAACCTGGCTGTCATGAGGCCATGAAGGAAATATTACCAGCAGATGGAATTTAATCTAATTACAAGCTTCAAGTTGACGTGAAATTGCTCTTTTTAGGAGCTGCAGAAGGTTTCTAACTCCACTTCCTTCTCATGCAGCTGAGAAAAATGCCAACCATTAAAAGAGAGCAGGAATGTGCAGATTCACGCAACAATATGGAAAATATTCTTGTTCTTAGTTCAAACATACCAGACATGTCAGAATCCATGGACTCCAGCAATGATATGTTGTACAGCGAAGGGGCACCAGCGAAAAACAAAAACTCCTCATGTCGGAGGAAAAGGGAATTTATCCCAGATGAAAAGAAAGATGCTATGTACTGGGAAAAAAGACGGAAAAACAATGAAGCTGCAAAAAGGTCGAGAGAAAAACGGAGATTAAATGACATGGTTTTGGAAAATAAACTTATTGCACTAGGAGAGGAGAATGCCAGTCTGAAAACAGAACTGCTGTCTTTAAAACTTAAATTTGGCTTGATTAGTTCTGCTTCCTATGCCCAAGAAATACAAAAGGTCACAACCTCCACTGCAATGTATTTTCAGGAATACTCATCTTCCAAACCAAATGTAATGTCGTATAACAGTGATCATGAACATTCTGTAATGACCAGCAGTTGTATTTCAGTTATCAAGCACTCCCCACAAAGCTCTCTGTCTGATGTGTCTGAGGCATCATCCGTGGAGCATGTTCAGCCGAGCACTGTCCAGAGCAACTGCAGAAGTACTGATATAAACTTCCAAAGAATTAAACAGGAACCTATGGAAAGGGAGAACTTTTCTAGAGATGCCAGAGAAGACAGTAACACTTTCCAAGGCTCTATATATACCAATTATATTGGAAACACATTTTCTGGGTATTCACATTCTCCTCCACTTCTTCACATAAACAGATCGTCGAGTAACTCTCCGAGAACATCAGAAGCAGATGAAGGTGTGGTAGGAAAGACGTCTGATGGTGAGGATGAACAGCAGGTTCCTAAAGGTCCCATTCATTCCCCAGTTGAACTTAAAAACGGGCACACGACAATCATAAAGGTTCCAGAAGTGAACTCCTCTGCATTACCTCACAAGCTCCGCATAAAAGCAAAGGCTATGCAGATTAAAGTAGAAGCACTGGAAAGCGAACTTAATAGCACTCAAAAACTGACCCTGCCAATTGATATGTCCTCAAAGCGGCACTTACAGCTGGAAAAACACAACAGTGAAACCATGGTACATTCTTCTTTGTCACCTTTATCAGTTCAAGTAACTAATATACAGGACTGGCCACTAAAACCAGGTCAGTGGCACCACAGGGAACTTGATAAAATTCCAAGTGTTTGTAAAACATCTGGGATTGTGGATATAAAAGACAATGTCTTCAAAGCCTCTGAGTCAGAGAGCTTATATTTAAAGCAAGGTATTGCAAATCTATCTGCTGAGGTTGCAACCCTTAAAAGACTTATAGTAACCCAGGAAATCTGTGCATCCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGATTTTTTCATGATATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTCAAGTAATGATGTCTACTTAATATTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGATCACTATGCCTTGTGTACAGATAGGTAGCCAATGCAAGGCTGTAAATATCTTTAAACATTATTTTTGCCAGTCTGTTATAAATTGTGAAAGTTACCAGTTAAATAAAGTATTGGTGAAAAATATGTGCCTCGGGTTTGTATTAGAAATTTATTAGACACAAATAATAATGTTTGCGCTTTGGGATCCGCAACTATATTGCCAATGTTCTTCTTTACATCAGACTCCAGCATCAACTATGAAAGAAGCTGATAGAAACATGTTAATGTAATGACCCCATTACTAATGCAATTATTGTCATTGTTATCATCAGAAACTTATATTCAAGTAAGAGCTTAATAGCTCCCAGACCAATACCTTTTGTAGCTTGAGACCAGGTATTCAAGTCACCCCAAATCCCCATCCCCTAGGGCAGCTCCATGAATGCCAGTGTTCAGGCTCTTTCAAAGAGCTGTCACTCAGATATGTGGCTATTGCCCATGTGGGCATGGCGGACACATGTGGAGGCTCATTTATCAAAATTCAAACTTTTGTACTTTTTGTGGACTGCTCTCCCATGAAAAAACTCAGAAATTAAAAAAGCACGAATGTTGACTTATTTATTTAAAGATCCGA
consensus depths 4 5 4 5 5 6 6 6 7 7 8 8 10 10 12 12 12 12 14 14 14 14 16 16 16 16 16 16 16 16 16 16 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 17 16 16 12 17 12 17 12 17 12 18 12 18 12 18 13 18 13 18 13 18 13 18 13 18 13 18 13 18 13 18 13 18 13 18 13 18 13 18 13 18 13 18 12 17 12 17 12 17 12 18 12 18 12 18 12 18 13 18 13 18 12 17 12 17 12 17 12 17 12 17 12 17 13 18 14 19 14 19 14 19 13 18 13 18 12 17 12 17 12 17 12 16 12 16 12 16 10 14 10 14 10 14 9 14 10 13 7 9 5 9 5 8 5 7 5 7 4 6 4 5 4 5 4 5 6 7 6 7 6 7 6 7 6 7 7 8 7 8 7 8 6 8 7 8 8 8 8 9 8 9 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 11 11 11 13 13 15 17 15 17 16 18 16 19 16 19 17 19 16 19 18 18 18 18 19 19 19 19 20 20 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 24 24 24 24 23 24 24 24 23 24 23 24 23 24 25 25 24 25 24 25 24 25 24 25 25 25 25 25 24 25 24 25 24 25 25 26 25 26 25 26 26 26 26 26 25 26 24 26 25 26 25 26 24 26 24 27 25 27 25 26 25 27 26 27 25 26 23 23 23 23 23 23 23 23 22 22 21 21 21 21 19 20 18 20 17 19 17 19 18 19 17 17 17 17 17 17 16 16 16 16 16 16 14 16 3 6 2 3 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2
5 1 2 SIG Xt7.1-CABH6060.3 GGGGAGGAGTATTGACCTACTAACACAGATCTGTAGAGCAGCAGCAGCAGGCTGCAGACTGGAGCGGGCAGAGACACTGATACACGCACGCATGCACACACGTACACACATAAGCACTGCACAGGAGGCGCTGCTTGACACTCCAGCGTTGTGATTTTTGTTTTATTCCCTTGTTGTTGGCATATCTGATCACATCAACTCCCAGGTACTGGCCACCCATGCCTGGAAAGGAGCAAGTGAAGTTCTTCCGTTAAATAAGAGCAAAGATGCCTATGAACTGATGCAAGCGCTAATGCAGAACAATTCTTGTGGGAAATTAAGTGATCCATCTTAACTTCTGATCAGGTCAAATTTTTGTTCCTGAGCATATAACGGAAATGGTTACAACCTGGCTGTCATGAGGCCATGAAGGAAATATTACCAGCAGATGGAATTTAATCTAATTACAAGCTTCAAGTTGACGTGAAATTGCTCTTTTTAGGAGCTGCAGAAGGTTTCTAACTCCACTTCCTTCTCATGCAGCTGAGAAAAATGCCAACCATTAAAAGAGAGCAGGAATGTGCAGATTCACGCAACAATATGGAAAATATTCTTGTTCTTAGTTCAAACATACCAGACATGTCAGAATCCATGGACTCCAGCAATGATATGTTGTACAGCGAAGGGGCACCAGCGAAAAACAAAAACTCCTCATGTCGGAGGAAAAGGGAATTTATCCCAGATGAAAAGAAAGATGCTATGTACTGGGAAAAAAGACGGAAAAACAATGAAGCTGCAAAAAGGTCGAGAGAAAAACGGAGATTAAATGACATGGTTTTGGAAAATAAACTTATTGCACTAGGAGAGGAGAATGCCAGTCTGAAAACAGAACTGCTGTCTTTAAAACTTAAATTTGGCTTGATTAGTTCTGCTTCCTATGCCCAAGAAATACAAAAGGTCACAACCTCCACTGCAATGTATTTTCAGGAATACTCATCTTCCAAACCAAATGTAATGTCGTATAACAGTGATCATGAACATTCTGTAATGACCAGCAGTTGTATTTCAGTTATCAAGCACTCCCCACAAAGCTCTCTGTCTGATGTGTCTGAGGCATCATCCGTGGAGCATGTTCAGCCGAGCACTGTCCAGAGCAACTGCAGAAGTACTGAT------------------------------------------------------------------------------------ACATTCTCCTCCACTTCTTCACATAAACAGATCGTCGAGTAACTCTCCGAGAACATCAGAAGCAGATGAAGGTGTGGTAGGAAAGACGTCTGATGGTGAGGATGAACAGCAGGTTCCTAAAGGTCCCATTCATTCCCCAGTTGAACTTAAAAACGGGCACACGACAATCATAAAGGTTCCAGAAGTGAACTCCTCTGCATTACCTCACAAGCTCCGCATAAAAGCAAAGGCTATGCAGATTAAAGTAGAAGCACTGGAAAGCGAACTTAATAGCACTCAAAAACTGACCCTGCCAATTGATATGTCCTCAAAGCGGCACTTACAGCTGGAAAAACACAACAGTGAAACCATGGTACATTCTTCTTTGTCACCTTTATCAGTTCAAGTAACTAATATACAGGACTGGCCACTAAAACCAGGTCAGTGGCACCACAGGGAACTTGATAAAATTCCAAGTGTTTGTAAAACATCTGGGATTGTGGATATAAAAGACAATGTCTTCAAAGCCTCTGAGTCAGAGAGCTTATATTTAAAGCAAGGTATTGCAAATCTATCTGCTGAGGTTGCAACCCTTAAAAGACTTATAGTAACCCAGGAAATCTGTGCATCCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGATTTTTTCATGATATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTCAAGTAATGATGTCTACTTAATATTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGATCACTATGCCTTGTGTACAGATAGGTAGCCAATGCAAGGCTGTAAATATCTTTAAACATTATTTTTGCCAGTCTGTTATAAATTGTGAAAGTTACCAGTTAAATAAAGTATTGGTGAAAAAAAAGGAA
5 1 2 SIG Xt7.1-CABD6323.3 TACTAACACAGATCTGTAGAGCAGCAGCAGCAGGCTGCAGACTGGAGCGGGGAGAAACACTGATACACGCACGCATGCACACACGTACACACATAAGCACTGCACAGGAGGCGCTGCTTGACACTCCAGCGTTGTGATTTTTGTTTTATTCCCTTGTTGTTGGCATATCTGATCACATCAACTCCCAGGTACTGGCCACCCATGCCTGGAAAGGAGCAAGTGAAGTTCTTCCGTTAAATAAGAGCAAAGATGCCTATGAACTGATGCAAGCGCTAATGCAGGTCAAATTTTTGTTCCTGAGCATATAACGGAAATGGTTACAACCTGGCTGTCATGAGGCCATGAAGGAAATATTACCAGCAGATGGAATTTAATCTAATTACAAGCTTCAAGTTGACGTGAAATTGCTCTTTTTAGGAGCTGCAGAAGGTTTCTAACTCCACTTCCTTCTCATGCAGCTGAGAAAAATGCCAACCATTAAAAGAGAGCAGGAATGTGCAGATTCACGCAACAATATGGAAAATATTCTTGTTCTTAGTTCAAACATACCAGACATGTCAGAATCCATGGACTCCAGCAATGATATGTTGTACAGCGAAGGGGCACCAGCGAAAAACAAAAACTCCTCATGTCGGAGGAAAAGGGAATTTATCCCAGATGAAAAGAAAGATGCTATGTACTGGGAAAAAAGACGGAAAAACAATGAAGCTGCAAAAAGGTCGAGAGAAAAACGGAGATTAAATGACATGGTTTTGGAAAATAAACTTATTGCACTAGGAGAGGAGAATGCCAGTCTGAAAACAGAACTGCTGTCTTTAAAACTTAAATTTGGCTTGATTAGTTCTGCTTCCTATGCCCAAGAAATACAAAAGGTCACAACCTCCACTGCAATGTATTTTCAGGAATACTCATCTTCCAAACCAAATGTAATGTCGTATAACAGTGATCATGAACATTCTGTAATGACCAGCAGTTGTATTTCAGTTATCAAGCACTCCCCACAAAGCTCTCTGTCTGATGTGTCTGAGGCATCATCCGTGGAGCATGTTCAGCCGAGCACTGTCCAGAGCAACTGCAGAAGTACTGATATAAACTTCCAAAGAATTAAACAGGAACCTATGGAAAGGGAGAACTTTTCTAGAGATGCCAGAGAAGACAGTAACACTTTCCAAGGCTCTATATATACCAATTATATTGGAAACACATTTTCTGGGTATTCACATTCTCCTCCACTTCTTCACATAAACAGATCGTCGAGTAACTCTCCGAGAACATCAGAAGCAGATGAAGGTGTGGTAGGAAAGACGTCTGATGGTGAGGATGAACAGCAGGTTCCTAAAGGTCCCATTCATTCCCCAGTTGAACTTAAAAACGGGCACACGACAATCATAAAGGTTCCAGAAGTGAACTCCTCTGCATTACCTCACAAGCTCCGCATAAAAGCAAAGGCTATGCAGATTAAAGTAGAAGCACTGGAAAGCGAACTTAATAGCACTCAAAAACTGACCCTGCCAATTGATATGTCCTCAAAGCGGCACTTACAGCTGGAAAAACACAACAGTGAAACCATGGTACATTCTTCTTTGTCACCTTTATCAGTTCAAGTAACTAATATACAGGACTGGCCACTAAAACCAGGTCAGTGGCACCACAGGGAACTTGATAAAATTCCAAGTGTTTGTAAAACATCTGGGATTGTGGATATAAAAGACAATGTCTTCAAAGCCTCTGAGTCAGAGAGCTTATATTTAAAGCAAGGTATTGCAAATCTATCTGCTGAGGTTGCAACCCTTAAAAGACTTATAGTAACCCAGGAAATCTGTGCATCCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGATTTTTTCATGATATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTCAAGTAATGATGTCTACTTAATATTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGATCACTATGCCTTGTGTACAGATAGGTAGCCAATGCAAGGCTGTAAATATCTTTAAACATTATTTTTGCCAGTCTGTTATAAATTGTGAAAGTTACCAGTTAAATAAAGTATTGGTGAAAAATATGTGCCTCGGGTTTGTATTAGAAATTTATTAGACACAAATAATAATGTTTGCGCTTTGGGATCCGCAACTATATTGCCAATGTTCTTCTTTACATCAGACTCCAGCATCAACTATGAAAGAAGCTGATAGAAACATGTTAATGTAATGACCCCATTACTAATGCAATTATTGTCATTGTTATCATCAGAAACTTATATTCAAGTAAGAGCTTAATAGCTCCCAGACCAATACCTTTTGTAGCTTGAGACCAGGTATTCAAGTCACCCCAAATCCCCATCCCCTAGGGCAGCTCCATGAATGCCAGTGTTCAGGCTCTTTCAAAGAGCTGTCACTCAGATATGTGGCTATTGCCCATGTGGGCATGGCGGACACATGTGGAGGCTCATTTATCAAAATTCAAACTTTTGTACTTTTTGTGGACTGCTCTCCCATGAAAAAACTCAGAAATTAAAAAAGCACGAATGTTGACTTATTTATTTAAAGATCCGA
VAR ACAATTCTTGTGGGAAATTAAGTGATCCATCTTAACTTCTGATCAGGTCAAATTTTTGTTCCTGAGCATATAACGGAAATGGTTACAACCTGGCTGTCATGAGGCCATGAAGGAAATATTACCAGCAGATGGAATTTAATCTAATTACAAGCTTCAAGTTGACGTGAAATTGCTCTTTTTAGGAGCTGCAGAAGGTTTCTAACTCCACTTCCTTCTCATGCAGCTGAGAAAAATGCCAACCATTAAAAGAGAGCAGGAATGTGCAGATTCACGCAACAATATGGAAAATATTCTTGTTCTTAGTTCAAACATACCAGACATGTCAGAATCCATGGACTCCAGCAATGATATGTTGTACAGCGAAGGGGCACCAGCGAAAAACAAAAACTCCTCATGTCGGAGGAAAAGGGAATTTATCCCAGATGAAAAGAAAGATGCTATGTACTGGGAAAAAAGACGGAAAAACAATGAAGCTGCAAAAAGGTCGAGAGAAAAACGGAGATTAAATGACATGGTTTTGGAAAATAAACTTATTGCACTAGGAGAGGAGAATGCCAGTCTGAAAACAGAACTGCTGTCTTTAAAACTTAAATTTGGCTTGATTAGTTCTGC
SNP ---------G--
SNP -A----------
SNP -------C----
SNP -----------A
BLH ATG 458 902
BLH MIN 458 193
BLH OVR 458 475
ORF LNG 458 49
PREDICTED - Sp ---- 3e-011 XP_797650.1 PREDICTED: similar to hepatic leukemia factor [Strongylocentrotus purpuratus] --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------=============================================================================================================================================================================================================================================
PROTEIN --- Ce ---- 2e-013 NP_495861.1 basic-leucine zipper transcription factor (2J43) [Caenorhabditis elegans] =================================================================================================================================================================================================================
PROTEIN --- Ci ---- 5e-015 BAE06578.1 transcription factor protein [Ciona intestinalis] =========================================================================================================================
PROTEIN --- Dm ---- 4e-019 NP_723075.1 CG14029-PC, isoform C [Drosophila melanogaster] --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------=============================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
PROTEIN === Dr ==== 3e-116 NP_001004120.1 zgc:100867 [Danio rerio] ===============================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
PROTEIN === Mm ==== 2e-174 NP_059069.1 nuclear factor, interleukin 3, regulated [Mus musculus] ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
PROTEIN === Gg ==== 0 NP_989949.1 nuclear factor, interleukin 3 regulated [Gallus gallus] ====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
PROTEIN === Hs ==== 0 NP_005375.2 nuclear factor, interleukin 3 regulated [Homo sapiens] =====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
PROTEIN === Xl ==== 0 AAH81074.1 MGC82043 protein [Xenopus laevis] ===============================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
PROTEIN === Xt ==== 0 NP_001015710.1 MGC107826 protein [Xenopus tropicalis] =====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
PROTEIN === ?? ==== 0 Q5FW38.1 Nuclear factor interleukin-3-regulated protein [(unknown)] ======================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
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ORF [ open reading frame ]
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5 1 2 ext Mus1 in CABH2079.5p CCAGAGAAGACAGTAACACTTTCCAAGGCTCTATATATACCAATTATATTGGAAACACATTTTCTGGGTATTCACATTCTCCTCCACTTCTTCACATAAACAGATCGTCGAGTAACTCTCCGAGAACATCAGAAGCAGATGAAGGTGTGGTAGGAAAGACGTCTGATGGTGAGGATGAACAGCAGGTTCCTAAAGGTCCCATTCATTCCCCAGTTGAACTTAAAAACGGGCACACGACAATCATAAAGGTTCCAGAAGTGAACTCCTCTGCATTACCTCACAAGCTCCGCATAAAAGCAAAGGCTATGCAGATTAAAGTAGAAGCACTGGAAAGCGAACTTAATAGCACTCAAAAACTGACCCTGCCAATTGATATGTCCTCAAAGCGGCACTTACAGCTGGAAAAACACAACAGTGAAACCATGGTACATTCTTCTTTGTCACCTTTATCAGTTCAAGTAACTAATATACAGGACTGGCCACTAAAACCAGGTCAGTGGCACCACAGGGAACTTGATAAAATTCCAAGTGTTTGTAAAACATCTGGGATTGTGGATATAAAAGACAATGTCTTCAAAGCCTCTGAGTCAGAGAGCTTATATTTAAAGCAAGGTATTGCAAATCTATCTGCTGAGGTTGCAACCCTTAAAAGACTTATAGTAACCCAGGAAATCTGTGCATCCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGATTTTTTCATGATATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTTCAGTAATGATGTCTACTTAATATTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGA
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3 1 3 nb Int1 5g3 in CAAP2414.3p ACATAAACAGATCGTCGAGTAACTCTCCGAGAACATCAGAAGCAGATGAAGGTGTGGTAGGAAAGACGTCTGATGGTGAGGATGAACAGCAGGTTCCTAAAGGTCCCATTCATTCCCCAGTTGAACTTAAAAACGGGCACACGACAATCATAAAGGTTCCAGAAGTGAACTCCTCTGCATTACCTCACAAGCTCCGCATAAAAGCAAAGGCTATGCAGATTAAAGTAGAAGCACTGGAAAGCGAACTTAATAGCACTCAAAAACTGACCCTGCCAATTGATATGTCCTCAAAGCGGCACTTACAGCTGGAAAAACACAACAGTGAAACCATGGTACATTCTTCTTTGTCACCTTTATCAGTTCAAGTAACTAATATACAGGACTGGCCACTAAAACCAGGTCAGTGGCACCACAGGGAACTTGATAAAATTCCAAGTGTTTGTAAAACATCTGGGATTGTGGATATAAAAGACAATGTCTTCAAAGCCTCTGAGTCAGAGAGCTTATATTTAAAGCAAGGTATTGCAAATCTATCTGCTGAGGTTGCAACCCTTAAAAGACTTATAGTAACCCAGGAAATCTGTGCATCCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGATTTTTTCATGATATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTCAAGTAATGATGTCTACTTAACTCTTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGATCACTATGCCTTGTGTACAGATAGGTAGCCA
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3 1 3 nb Lun1 in CABD5295.3p GACAATCATAAAGGTTCCAGAAGTGAACTCCTCTGCATTACCTCACAAGCTCCGCATAAAAGCAAAGGCTATGCAGATTAAAGTAGAAGCACTGGAAAGCGAACTTAATAGCACTCAAAAACTGACCCTGCCAATTGATATGTCCTCAAAGCGGCACTTACAGCTGGAAAAACACAACAGTGAAACCATGGTACATTCTTCTTTGTCACCTTTATCAGTTCAAGTAACTAATATACAGGACTGGCCACTAAAACCAGGTCAGTGGCACCACAGGGAACTTGATAAAATTCCAAGTGTTTGTAAAACATCTGGGATTGTGGATATAAAAGACAATGTCTTCAAAGCCTCTGAGTCAGAGAGCTTATATTTAAAGCAAGGTATTGCAAATCTATCTGCTGAGGTTGCAACCCTTAAAAGACTTATAGTAACCCAGGAAATCTGTGCATCCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGATTTTTTCATGATATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTCAAGTAATGATGTCTACTTAATATTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGATCACTATGCCTTGTGTACAGATAGGTAGCCAATGCAAGGCTGTAAATATCTTTAAACATTATTTTTGCCAGTCTGTTATAAATTGTGAAAGTTACCAGTTAAATAAAGTATTGGTG
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3 1 2 ext Bone 5g3 in CBTC10667.rev CTGCATTACCTCACAAGCTCCGCATAAAAGCAAAGGCTATGCAGATTAAAGTAGAAGCACTGGAAAGCGAACTTAATAGCACTCAAAAACTGACCCTGCCAATTGATATGTCCTCAAAGCGGCACTTACAGCTGGAAAAACACAACAGTGAAACCATGGTACATTCTTCTTTGTCACCTTTATCAGTTCAAGTAACTAATATACAGGACTGGCCACTAAAACCAGGTCAGTGGCACCACAGGGAACTTGATAAAATTCCAAGTGTTTGTAAAACATCTGGGATTGTGGATATAAAAGACAATGTCTTCAAAGCCTCTGAGTCAGAGAGCTTATATTTAAAGCAAGGTATTGCAAATCTATCTGCTGAGGTTGCAACCCTTAAAAGACTTATAGTAACCCAGGAAATCTGTGCATCCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGATTTTTTCATGATATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTCAAGTAATGATGTCTACTTAATATTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGATCACTATGCCTTGTGTACAGATAGGTAGCCAATGCAAGGCTGTAAATATCTTTAAACATTATTTTTGCCAGTCTGTTATAAATTGTGAAAGTTACCAGTTAAATAAAGTATTGGTG
3 1 3 nb Limb 5g3 in CBSU5448.rev TGCATTACCTCACAAGCTCCGCATAAAAGCAAAGGCTATGCAGATTAAAGTAGAAGCACTGGAAAGCGAACTTAATAGCACTCAAAAACTGACCCTGCCAATTGATATGTCCTCAAAGCGGCACTTACAGCTGGAAAAACACAACAGTGAAACCATGGTACATTCTTCTTTGTCACCTTTATCAGTTCAAGTAACTAATATACAGGACTGGCCACTAAAACCAGGTCAGTGGCACCACAGGGAACTTGATAAAATTCCAAGTGTTTGTAAAACATCTGGGATTGTGGATATAAAAGACAATGTCTTCAAAGCCTCTGAGTCAGAGAGCTTATATTTAAAGCAAGGTATTGCAAATCTATCTGCTGAGGTTGCAACCCTTAAAAGACTTATAGTAACCCAGGAAATCTGTGCATCCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGATTTTTTCATGATATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTCAAGTAATGATGTCTACTTAATATTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGATCACTATGCCTTGTGTACAGATAGGTAGCCAATGCAAGGCTGTAAATATCTTTAAACATTATTTTTGCCAGTCTGTTATAAATTGTGAAAGTTACCAGTTAAATAAAGTATTGGTG
3 1 3 nb Tad5 in XZT14087.3p TTTCCTCACAAGCTCCGCATAAAAGCAAAGGCTATGCAGATTAAAGTAGAAGCACTGGAAAGCGAACTTAATAGCACTCAAAAACTGACCCTGCCAATTGATATGTCCTCAAAGCGGCACTTACAGCTGGAAAAACACAACAGTGAACCCATGGTACATTCTTCTTTGTCACCTTTATCAGTTCAAGTAACTAATATACAGGACTGGCCACTAAAACCAGGTCAGTGGCACCACAGGGAACTTGATAAAATTCCAAGTGTTTGTAAAACATCTGGGATTGTGGATATAAAAGACAATGTCTTCAAAGCCTCTGAGTCAGAGAGCTTATATTTAAAGCAAGGTATTGCAAATCTATCTGCTGAGGTTGCAACCCTTAAAAGACTTATAGTAACCCAGGAAATCTGTGCATCCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGATTTTTTCATGATATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTCAAGTAATGATGTCTACTTAATATTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGATCACTATGCCTTGTGTACAGATAGGTAGCCAATGCAAGGCTGTAAATATCTTTAAACATTATTTTTGCCAGTCTGTTATAAATTGTGAAAGTTACCAGTTAAATAAAGTATGGTG
3 1 3 nb Ski1 in CABJ3748.3p ATAGCCCTCAAAAACTGGCCCTGCCAATTGATATGTCCTCAAAGGGGGCCTTTCAGGGGGGAAAACCCCACAGGGGAACCCGGGGCCCTTTTTTTTTGTCCCCTTTTTCAGTTCAAGGAACTAATATACAGGGCTGGCCCCTAAAACCAGGTCAGGGGCCCCCCCGGGGACTTGATAAAATTCCAAGGGTTTGTAAAACATTTGGGGTTGGGGGTATAAAAGACAAAGTTTTTAAAGCCTTTGGGTTGGGGGGGTTTTTTTTAAAGCAAGGGTTTGCAAATTTTTTTGGGGGGGGTGGAACCCTTAAAAGGCTTTTTGTTACCCCGGGAATTTGGGCCTCCAATTCCCGTTAAAAGGACTACTGGTTTTTTCCTG
3 1 3 nb Bone CBTC10658.rev CCTTTATCAGTTCAAGTAATTAGTATGCAGGGGTGGCCACTAGAACCAGGTCAGTGGCACCACAGGGAACTTGATAAAATTCCAAGTGTTAGTAAAACATCTGGGATTGGGGATATAAAAGACAATGTCTTCAAAGCCTCTGAGTCAGAGAGCTTATATTTAAAGCAAGGTATTGCAAATCTTTTTGCTGAGGTTGCAGCCCTTAAAAGACTTATAGTAACCCAGGAAATCTGTGCATGCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGTTTTTTTCATGATATGCATATGGTAAAGTTAGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTG
5 1 2 ext TpA in TTpA024p06.p1kSP6 ATATAAAAGACAATGTCTTCAAGCCTCTGAGTCAGAGAGCTTATATTTAAAGCAAGGTATTGCAAATCTATCTGCTGAGGTTGCAACCCTTAAAAGACTTATAGTAACCCAGGAAATCTGTGCATCCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGATTTTTTCATGATATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTCAAGTAATGATGTCTACTTAATATTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGATCACTATGCCTTGTGTACAGATAGGTAGCCAATGCAAGGCTGTAAATATCTTTAAACATTATTTTTGCCAGTCTGTTATAAATTGTGAAAGTTACCAGTTAAATAAAGTATTGGTGAAAAATATGTGCCTCGGGTTTG
3 1 2 ext TpA in TTpA024p06.q1kT7 GCATCCAATTCCAGTTAAAAGTACTACTGATTTTTTCATGATATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTCAAGTAATGATGTCTACTTAATATTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGATCACTATGCCTTGTGTACAGATAGGTAGCCAATGCAAGGCTGTAAATATCTTTAAACATTATTTTTGCCAGTCTGTTATAAATTGTGAAAGTTACCAGTTAAATAAAGTATTGGTGAAAAATATGTGCCTCGGGTTTGTATTAGAAATTTATTAGACACAAATAATAATGTTTGCGCTTTGGGATCCGCAACTATATTGCCAATGTTCTTCTTTACATCAGACTCCAGCATCAACTATGAAAGAAGCTGATAGAAACATGTTAATGTAATGACCCCATTACTAATGCAATTATTGTCATTGTTATCATCAGAAACTTATATTCAAGTAAGAGCTTAATAGCTCCCAGACCAATACCTTTTGTAGCTTGAGACCAGGTATTCAAGTCACCCCAAATCCCCATCCCCTAGGGCAGCTCCATGAATGCCAGTGTTCAGGCTCTTTCAAAGAGCTGTCACTCAGATATGTGGCTATTGCCCATGTGGGCATGGCGGACACATGTGGAGGCTCATTTATCAAAATTCAAACTTTTGTACTTTTTGTGGACTGCTCTCCCATGAAAAAACTCAGAAATTAAAAAAGCACGAATGTTGACTTATTTATTTAAAGATCCGAATTAAAAAGCATGAACAAATAAAATGTGACAAAAAAAAAAAAAAAA
3 1 2 ext Bone in CBTC9617.rev ATGCATATTGTAAAGATTGTAGTTTGCAGTAAATTGGTATGTTTTGTATAATGCTCAGTTTTCACTGGTATTGTGACGTCATTTCACTGTACTGTTCAAGTAATGATGTCTACTTAATATTGTCCTTTTTTGTGCACAACTGTGTTATGATCACTATGCCTTGTGTACAGATAGGTAGCCAATGCAAGGCTGTAAATATCTTTAAACATTATTTTTGCCAGTCTGTTATAAATTGTGAAAGTTACCAGTTAAATAAAGTATTGGTGAAAAATATGTGCCTCGGGTTTGTATTAGAAATTTATTAGACACAAATAATAATGTTTGCGCTTTGGGATCCGCAACTATATTGCCAATGTTCTTCTTTACATCAGACTCCAGCATCAACTATGAAAGAAGCTGATAGAAACATGTTAATGTAATGACCCCATTACTAATGCAATTATTGTCATTGTTATCATCAGAAACTTATATTCAAGTAAGAGCTTAATAGCTCCCAGACCAATACCTTTTGTAGCTTGAGACCAGGTATTCAAGTCACCCCAAATCCCCATCCCCTAGGGCAGCTCCATGAATGCCAGTGTTCAGGCTCTTTCAAAGAGCTGTCACTCAGATATGTGGCTATTGCCCATGTGGGCATGGCGGACACATGTGGAGGCTCATTTATCAAAATTCAAACTTTTGTACTTTTTGTGGACTGCTCTCCCATGAAAAAACTCAGAAATTAAAAAAGCACGAATGTTGACTTATTTATTTAAAGATCCGAATATAAAAAGCATGAACAAATAAAAATGTTGAAC
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