Gurdon Institute Xenopus tropicalis EST Database

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+ Application in use by Guest User - 20 Jan 2022 - database INFO-PUBLIC =
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Data may take 10 - 20 seconds to download, please be patient

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=

.


Estimated expression levels relative to total library clones.
(detailed explanation)

0.001% 0.001%
Stage specific expression levels Tissue specific expression levels
stage 1 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60tissue Bod Bone Brn Eye Fat Hrt Int Kid Liv Lun Mus Ova Ovi Panc Ski Spl Sto Te Thy

 Related Clusters
(none)

 This cluster: approximate FL confidence score = 0%

 1012108719 Xt7.1-CBWN15602.5 - 2 ESTs
                                                                       -250......-240......-230......-220......-210......-200......-190......-180......-170......-160......-150......-140......-130......-120......-110......-100......-90.......-80.......-70.......-60.......-50.......-40.......-30.......-20.......-10.......0.........10........20........30........40........50........60........70........80........90........100.......110.......120.......130.......140.......150.......160.......170.......180.......190.......200.......210.......220.......230.......240.......250.......260.......270.......280.......290.......300.......310.......320.......330.......340.......350.......360.......370.......380.......390.......400.......410.......420.......430.......440.......450.......460.......470.......480.......490.......500.......510.......520.......530.......540.......550.......560.......570.......580.......590.......600.......610.......620.......630.......640.......650.......660.......670.......680.......690.......700.......710.......720.......730.......740.......750.......760.......770.......780.......790.......800.......810.......820.......830.......840.......850.......860.......870.......880.......890.......900.......910.......920.......930.......940.......950.......960.......970.......980.......990.......1000......1010......1020......1030......1040......1050......1060......1070......1080......1090......1100......1110......1120......1130......1140......1150......1160......1170......1180......1190......1200......1210......1220......1230......1240......1250......1260......1270......1280......1290......1300
 ?   ?   ?    ?    ?     ?    ?   ? 
                                                     Xt7.1-CBWN15602.5                                                                                                                                                                                                                                                           CCAGTATGGCTGCTATTCTGTACTCCATCAAACAAGATATAGATGCTTTAAACTTGAGTAAAATTCTTGTTATCATGCCCAAGAACAGAAGAGCACAAATGGACATATTTGTAGATTATTTGTTTACTGACCTATACAAGTTTACCTTTCAACCATTTGAAATACAAGCAGAAAAAGACAGTTTAAATTGCACATCTGGCAAAAAACACGTTGGGGATGATATTTCTCATGGGAATTTAAGAGACATAACTGTAAGAAGCATCAGAACGCACCTGGAAACATTGCCAGCTCTGAAAGGGAATATTGTTATTCTTAAATCATACCTTATTCCAGAGACTAATTTTCTGCATGGGTTTACCACGAGAACAGGCGGCATCTCATATGTACCAACGCTCAGCTCCCTTAACCTCTTTAGCAGCTCTAAGAGGAGAGACCCCAGGGAGGTTGTTGCAGAGAATTTCCGCCGGTTAGGCAAAGCCGCTGGGTTTGATCCAAAGACGTATGTCTCTGTGAAGGTTGATCATGCCAGTGATGTTTGGATCATGGGTAAAAGTGAACCAGACAGCTACGATGGAATTGTCACTAACCAGAAAGGAGTCACAATAGCAGCCCCCGGGGCAGATTGTATCCCAATGCTGTTTTGTGACCCTGTCCGTAAAGCATGTGGTGCAGCTCATTCAGGCTGGAAAGGGACCCTGCTAGGTGTTGCAATGGCCACAGTTAATTCAATGGTGTCTGAGTATGCATGTCATGTTGAGGACATCTTGGTTGTACTTGGTCCTTCTGTTGGTCCCTGCTGCTTTACACTGACACAGGAAGAAGCCAGAGCTTTTCATGATATTGACCCCCAGTGTGTTCGTGAGTTTAATTCACCAAACCCCTATGTAGACATAAGAAGAACAACAAGAATTTTTTTGGAACGTGGGGGCATTTTGCCACAGAACATTCAGGATGATACGGTTTCGGACAGGAGCCAGAATGTCACTCTTTGCACCTCCTGCCACCCAGACAAGTTTTTCTCCCATGTGCGGGATGGCCTCAATTTCGGGACACAGATTGGATTCATATCAATTAGAGAATAACTGCACCTCTGCAGCGAGGCCTCACAAAGCAATTACAGGAGATAATGAAGAAGTGGAGTCATTTGCTCCTGATATTCTTCTGTTGGTTGCAGCTAGGAAAACCAATAAATGAACAGAAACTATGGCAAAACTGGTGCATGGAGTGAATGAGTAGCAAATGATTATGTGAACACTAATATGATGAAGGTATAATAAATATATTTATTGAAAAAAA
                                                  Xt7.1-CHK-1008260401                                                                                                                                                                                                                                                                 TGGCTGCTATTCTGTACTCCATCAAACAAGATATAGATGCTTTAAACTTGAGTAAAATTCTTGTTATCATGCCCAAGAACAGAAGAGCACAAATGGACATATTTGTAGATTATTTGTTTACTGACCTATACAAGTTTACCTTTCAACCATTTGAAATACAAGCAGAAAAAGACAGTTTAAATTGCACATCTGGCAAAAAACACGTTGGGGATGATATTTCTCATGGGAATTTAAGAGACATAACTGTAAGAAGCATCAGAACGCACCTGGAAACATTGCCAGCTCTGAAAGGGAATATTGTTATTCTTAAATCATACCTTATTCCAGAGACTAATTTTCTGCATGGGTTTACCACGAGAACAGGCGGCATCTCATATGTACCAACGCTCAGCTCCCTTAACCTCTTTAGCAGCTCTAAGAGGAGAGACCCCAGGGAGGTTGTTGCAGAGAATTTCCGCCGGTTAGGCAAAGCCGCTGGGTTTGATCCAAAGACGTATGTCTCTGTGAAGGTTGATCATGCCAGTGATGTTTGGATCATGGGTAAAAGTGAACCAGACAGCTACGATGGAATTGTCACTAACCAGAAAGGAGTCACAATAGCAGCCCCCGGGGCAGATTGTATCCCAATGCTGTTTTGTGACCCTGTCCGTAAAGCATGTGGTGCAGCTCATTCAGGCTGGAAAGGGACCCTGCTAGGTGTTGCAATGGCCACAGTTAATTCAATGGTGTCTGAGTATGCATGTCATGTTGAGGACATCTTGGTTGTACTTGGTCCTTCTGTTGGTCCCTGCTGCTTTACACTGACACAGGAAGAAGCCAGAGCTTTTCATGATATTGACCCCCAGTGTGTTCGTGAGTTTAATTCACCAAACCCCTATGTAGACATAAGAAGAACAACAAGAATTTTTTTGGAACGTGGGGGCATTTTGCCACAGAACATTCAGGATGATACGGTTTCGGACAGGAGCCAGAATGTCACTCTTTGCACCTCCTGCCACCCAGACAAGTTTTTCTCCCATGTGCGGGATGGCCTCAATTTCGGGACACAGATTGGATTCATATCAATTAGAGAATAACTGCACCTCTGCAGCGAGGCCTCACAAAGCAATTACAGGAGATAATGAAGAAGTGGAGTCATTTGCTCCTGATATTCTTCTGTTGGTTGCAGCTAGGAAAACCAATAAATGAACAGAAACTATGGCAAAACTGGTGCATGGAGTGAATGAGTAGCAAATGATTATGTGAACACTAATATGATGAAGGTATAATAAATATATTTATTGAAAAAAAAAAAAA
                                                      consensus depths                                                                                                                                                                                                                                                                1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     2     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1     1
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                                                                             PREDICTED - Hs ---- 9e-128     NP_694950.1 hypothetical protein FLJ38725 [Homo sapiens] --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------=====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
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                                                                       PROTEIN --- Xl ---- 0          AAH78069.1 MGC82926 protein [Xenopus laevis] --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------=====================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================================
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                                                     Xt7.1-CBWN15602.5                                                                                                                                                                                                                                                                ATG------------------------------------------------------------------ATG---------------------ATG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATG---------------------------------------------------------------------------------------ATG---------------------------------------------------------------------------ATG---------------ATG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAA------------------------------------------TAATGA---------------------TGA---------------------TAG---------TAAATG------------------------------------TGA---------------------------ATGATG------TAATAA
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  5   1   2      seed Te1       in                        CBWN15602.b1                                                                                                                                                                                                                                                           CCAGTATGGCTGCTATTCTGTACTCCATCAAACAAGATATAGATGCTTTAAACTTGAGTAAAATTCTTGTTATCATGCCCAAGAACAGAAGAGCACAAATGGACATATTTGTAGATTATTTGTTTACTGACCTATACAAGTTTACCTTTCAACCATTTGAAATACAAGCAGAAAAAGACAGTTTAAATTGCACATCTGGCAAAAAACACGTTGGGGATGATATTTCTCATGGGAATTTAAGAGACATAACTGTAAGAAGCATCAGAACGCACCTGGAAACATTGCCAGCTCTGAAAGGGAATATTGTTATTCTTAAATCATACCTTATTCCAGAGACTAATTTTCTGCATGGGTTTACCACGAGAACAGGCGGCATCTCATATGTACCAACGCTCAGCTCCCTTAACCTCTTTAGCAGCTCTAAGAGGAGAGACCCCAGGGAGGTTGTTGCAGAGAATTTCCGCCGGTTAGGCAAAGCCGCTGGGTTTGATCCAAAGACGTATGTCTCTGTGAAGGTTGATCATGCCAGTGATGTTTGGATCATGGGTAAAAGTGAACCAGACAGCTACGATGGAATTGTCACTAACCAGAAAGGAGTCACAATAGCAGCCCCCGGGGCAGATTGTATCCCAATGCTGTTTTGTGACCCTGTCCGTAAAGCATGTGGTGCAGCTCATTCAGGCTGGAAAGGGACCCTGCTAGGTGTTGCAATGGCCACAGTTAATTCAATGGTGTCTGAGTATGCATGTCATGTTGAGGACATCTTGGTTGTACTTGGTCCTTCTGTTGGTCCCTGCTGCTTTACACTGACA
  3   1   2       bld Te1       in                        CBWN15602.g1                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACGTATGTCTCTGTGAAGGTTGATCATGCCAGTGATGTTTGGATCATGGGTAAAAGTGAACCAGACAGCTACGATGGAATTGTCACTAACCAGAAAGGAGTCACAATAGCAGCCCCCGGGGCAGATTGTATCCCAATGCTGTTTTGTGACCCTGTCCGTAAAGCATGTGGTGCAGCTCATTCAGGCTGGAAAGGGACCCTGCTAGGTGTTGCAATGGCCACAGTTAATTCAATGGTGTCTGAGTATGCATGTCATGTTGAGGACATCTTGGTTGTACTTGGTCCTTCTGTTGGTCCCTGCTGCTTTACACTGACACAGGAAGAAGCCAGAGCTTTTCATGATATTGACCCCCAGTGTGTTCGTGAGTTTAATTCACCAAACCCCTATGTAGACATAAGAAGAACAACAAGAATTTTTTTGGAACGTGGGGGCATTTTGCCACAGAACATTCAGGATGATACGGTTTCGGACAGGAGCCAGAATGTCACTCTTTGCACCTCCTGCCACCCAGACAAGTTTTTCTCCCATGTGCGGGATGGCCTCAATTTCGGGACACAGATTGGATTCATATCAATTAGAGAATAACTGCACCTCTGCAGCGAGGCCTCACAAAGCAATTACAGGAGATAATGAAGAAGTGGAGTCATTTGCTCCTGATATTCTTCTGTTGGTTGCAGCTAGGAAAACCAATAAATGAACAGAAACTATGGCAAAACTGGTGCATGGAGTGAATGAGTAGCAAATGATTATGTGAACACTAATATGATGAAGGTATAATAAATATATTTATTGAAAAAAAAAAAAAAA

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